More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1253 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
320 aa  644    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  84.84 
 
 
327 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  84.84 
 
 
327 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  76.85 
 
 
328 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  76.19 
 
 
330 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  75.87 
 
 
330 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  75.56 
 
 
330 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  75.56 
 
 
330 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  75.24 
 
 
329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.24 
 
 
329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.24 
 
 
329 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  75.24 
 
 
330 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  75.87 
 
 
329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  75.24 
 
 
330 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  75.24 
 
 
329 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  73.35 
 
 
329 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  72.27 
 
 
329 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  66.77 
 
 
312 aa  405  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  64.05 
 
 
319 aa  387  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  59.68 
 
 
345 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  61.17 
 
 
314 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  61.09 
 
 
316 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  60.06 
 
 
316 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  60.38 
 
 
316 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  60.77 
 
 
314 aa  358  6e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  60.84 
 
 
316 aa  355  6.999999999999999e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  58.36 
 
 
316 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  57.7 
 
 
316 aa  350  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  57.76 
 
 
324 aa  346  3e-94  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  58.84 
 
 
317 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  57.19 
 
 
306 aa  341  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  59.03 
 
 
315 aa  339  4e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  54.02 
 
 
319 aa  332  6e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  54.55 
 
 
340 aa  331  1e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  40.39 
 
 
313 aa  246  3e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.04 
 
 
320 aa  240  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.37 
 
 
320 aa  239  5.999999999999999e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  43.83 
 
 
317 aa  229  5e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.07 
 
 
270 aa  228  8e-59  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  39.67 
 
 
320 aa  167  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  37.66 
 
 
329 aa  162  9e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  36.94 
 
 
314 aa  160  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  37.62 
 
 
339 aa  157  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  38.71 
 
 
315 aa  157  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  38.27 
 
 
344 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  36.79 
 
 
301 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 
301 aa  154  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.95 
 
 
329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  37.05 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 
314 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  38.19 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  38.44 
 
 
318 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.67 
 
 
323 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  40.45 
 
 
321 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  33.66 
 
 
313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  39.33 
 
 
321 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 
322 aa  135  8e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  37.01 
 
 
323 aa  135  8e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.22 
 
 
320 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  33.78 
 
 
320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 
322 aa  132  6e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  30.77 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.2 
 
 
311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.72 
 
 
326 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.77 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.14 
 
 
291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.87 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30.89 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  32.97 
 
 
308 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  32.97 
 
 
308 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  33.55 
 
 
309 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.99 
 
 
319 aa  123  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.42 
 
 
309 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  33.58 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  33.58 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  32.27 
 
 
312 aa  120  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.58 
 
 
308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  36.33 
 
 
320 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  31.16 
 
 
315 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32.22 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  28.26 
 
 
628 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  27.64 
 
 
628 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.94 
 
 
308 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
308 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  32.01 
 
 
304 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.39 
 
 
312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
308 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  36.16 
 
 
308 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  32.6 
 
 
308 aa  113  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  31.68 
 
 
304 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.1 
 
 
308 aa  113  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  30.25 
 
 
299 aa  113  4.0000000000000004e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  30.65 
 
 
332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.11 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  34.38 
 
 
323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.47 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
635 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>