More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0502 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  100 
 
 
320 aa  652    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  64.97 
 
 
320 aa  417  9.999999999999999e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  52.79 
 
 
270 aa  300  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  43.44 
 
 
324 aa  248  1e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  43.79 
 
 
319 aa  246  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  43.04 
 
 
320 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  42.39 
 
 
312 aa  238  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  38.8 
 
 
313 aa  235  7e-61  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  42.17 
 
 
327 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  40.58 
 
 
319 aa  232  6e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  41.53 
 
 
327 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  41.53 
 
 
345 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  39.23 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  40.58 
 
 
329 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  41.67 
 
 
330 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  41.67 
 
 
330 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  40.84 
 
 
330 aa  222  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  41.67 
 
 
330 aa  222  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 
330 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  40.45 
 
 
314 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 
328 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.71 
 
 
329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  39.35 
 
 
314 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  41.35 
 
 
329 aa  216  5e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.03 
 
 
329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  41.03 
 
 
329 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  39.81 
 
 
316 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.03 
 
 
329 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  39.29 
 
 
316 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  39.55 
 
 
316 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  37.66 
 
 
315 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  38.91 
 
 
340 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 
316 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  38.75 
 
 
317 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  36.98 
 
 
316 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  38.41 
 
 
306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 
316 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  34.69 
 
 
317 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 
301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  32.31 
 
 
339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.59 
 
 
301 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  33.1 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.41 
 
 
319 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.81 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
326 aa  120  3e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  30.28 
 
 
344 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  27.38 
 
 
332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  30.82 
 
 
315 aa  116  5e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  29.64 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  28.27 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  29.34 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  29.71 
 
 
323 aa  113  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  26.77 
 
 
332 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.75 
 
 
314 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  26.77 
 
 
332 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  27.08 
 
 
332 aa  112  9e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  26.77 
 
 
332 aa  112  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  31.16 
 
 
628 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  29.78 
 
 
329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.79 
 
 
315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.04 
 
 
322 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  30.86 
 
 
628 aa  109  7.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  32.82 
 
 
343 aa  109  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  31.65 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  27.01 
 
 
338 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  29.94 
 
 
640 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  32.01 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  28.84 
 
 
327 aa  108  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  31.55 
 
 
316 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.44 
 
 
323 aa  108  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  28.87 
 
 
314 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 
315 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  30.58 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  28.71 
 
 
314 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  27.99 
 
 
315 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  28.31 
 
 
313 aa  106  6e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.91 
 
 
308 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 
319 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 
319 aa  106  7e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 
322 aa  105  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  25.4 
 
 
312 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  30.45 
 
 
326 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  27.98 
 
 
670 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 
636 aa  105  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  25.95 
 
 
315 aa  104  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  27.35 
 
 
646 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  25.63 
 
 
315 aa  103  3e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  25.63 
 
 
315 aa  103  3e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  25.63 
 
 
315 aa  104  3e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.81 
 
 
320 aa  103  4e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 
308 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  29.11 
 
 
321 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  27.3 
 
 
347 aa  103  5e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  25.63 
 
 
315 aa  103  5e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  24.53 
 
 
320 aa  103  5e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>