More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3008 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  100 
 
 
343 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  40.22 
 
 
363 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  42.01 
 
 
339 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  44.24 
 
 
326 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  43.17 
 
 
321 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  42.86 
 
 
320 aa  170  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  40.07 
 
 
314 aa  169  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  40.51 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  43.06 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 
329 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  35.71 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  33.55 
 
 
316 aa  120  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  36.2 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.41 
 
 
291 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  37.86 
 
 
318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  37.33 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.53 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  34.38 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.6 
 
 
320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.91 
 
 
329 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  34.91 
 
 
329 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  34.91 
 
 
329 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.59 
 
 
329 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  32.99 
 
 
330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 
312 aa  110  3e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  32.7 
 
 
316 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  28.17 
 
 
313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.82 
 
 
320 aa  109  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  32.18 
 
 
329 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  35.19 
 
 
324 aa  108  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.81 
 
 
318 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  32.59 
 
 
316 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.97 
 
 
330 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  32.73 
 
 
330 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 
330 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  32.06 
 
 
314 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  32.73 
 
 
330 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.97 
 
 
330 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  36 
 
 
311 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  36.07 
 
 
314 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.8 
 
 
313 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  31.88 
 
 
317 aa  103  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  32.04 
 
 
328 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  36.4 
 
 
342 aa  102  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  35.71 
 
 
318 aa  102  7e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  32.58 
 
 
316 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30 
 
 
308 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  31.67 
 
 
327 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  31.11 
 
 
319 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  30.28 
 
 
345 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 
319 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
340 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  33.01 
 
 
301 aa  100  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  33.57 
 
 
317 aa  99.8  6e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  29.08 
 
 
333 aa  99.4  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.47 
 
 
327 aa  99.4  8e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  31.49 
 
 
329 aa  99.4  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  28.27 
 
 
324 aa  99  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  32.72 
 
 
321 aa  99  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  25.33 
 
 
326 aa  98.6  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  28.72 
 
 
333 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  33.93 
 
 
320 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  34.52 
 
 
301 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  34.97 
 
 
327 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.78 
 
 
270 aa  97.1  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.44 
 
 
319 aa  96.3  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.01 
 
 
324 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  32.06 
 
 
327 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  25.9 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  31.85 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  31.85 
 
 
308 aa  92.8  8e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  29.71 
 
 
339 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  28.01 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  27.74 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  28.01 
 
 
332 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  33.65 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  25 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  28.01 
 
 
332 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  32.17 
 
 
314 aa  90.9  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  34.11 
 
 
321 aa  89.4  8e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  32.5 
 
 
315 aa  89.4  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  26.86 
 
 
338 aa  87.8  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  28.01 
 
 
332 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  28.67 
 
 
325 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  33.45 
 
 
306 aa  87.8  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  33.86 
 
 
329 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.73 
 
 
308 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  26.76 
 
 
323 aa  85.9  8e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  32.9 
 
 
322 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  23.91 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.73 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  29.93 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  29.55 
 
 
338 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  29.28 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
320 aa  82.8  0.000000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  28.8 
 
 
630 aa  82.8  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.07 
 
 
308 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>