More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3887 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  100 
 
 
314 aa  631  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  48.47 
 
 
339 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  48.28 
 
 
326 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  46.91 
 
 
321 aa  228  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  44.55 
 
 
320 aa  224  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  47.14 
 
 
320 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  44.16 
 
 
363 aa  202  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  39.81 
 
 
317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  40.07 
 
 
343 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  37.58 
 
 
323 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  37.74 
 
 
329 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  37.42 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  35.87 
 
 
327 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  37.01 
 
 
316 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
329 aa  160  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  36.94 
 
 
320 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  37.01 
 
 
316 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  39.42 
 
 
320 aa  159  8e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  37.29 
 
 
316 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  37.09 
 
 
340 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  34.8 
 
 
306 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  37.79 
 
 
317 aa  156  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  35.88 
 
 
314 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  37.29 
 
 
316 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  38.94 
 
 
314 aa  156  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  36.08 
 
 
327 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  36.88 
 
 
316 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  38.39 
 
 
314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  36.27 
 
 
330 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  36.3 
 
 
330 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  36.3 
 
 
330 aa  152  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  39.39 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 
328 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  35.14 
 
 
330 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  35.14 
 
 
330 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  35.91 
 
 
301 aa  149  5e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.48 
 
 
329 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  36.48 
 
 
329 aa  149  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  34.27 
 
 
319 aa  148  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  36.48 
 
 
329 aa  148  9e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 
301 aa  148  9e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  37.46 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  34.5 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.69 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  36.88 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.16 
 
 
329 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 
319 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  34.21 
 
 
345 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  37.01 
 
 
312 aa  144  3e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  35.22 
 
 
324 aa  142  5e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  36.28 
 
 
315 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.44 
 
 
291 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  35.47 
 
 
311 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  30.56 
 
 
313 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  34.44 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  35.06 
 
 
344 aa  129  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  32.86 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  36.48 
 
 
321 aa  127  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  35.6 
 
 
315 aa  125  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  38.71 
 
 
327 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  31.43 
 
 
332 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  31.49 
 
 
329 aa  122  6e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.81 
 
 
320 aa  122  8e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  36.54 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  30.26 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.94 
 
 
313 aa  117  3e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  30.56 
 
 
308 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  30.56 
 
 
308 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  28.85 
 
 
316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  29.89 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.73 
 
 
270 aa  110  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  30.91 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  30.36 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  30.63 
 
 
308 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.87 
 
 
320 aa  108  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.18 
 
 
326 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 
308 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.68 
 
 
309 aa  106  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.68 
 
 
309 aa  106  6e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  30.68 
 
 
309 aa  105  8e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.68 
 
 
309 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  29.74 
 
 
308 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.68 
 
 
309 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 
309 aa  105  8e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  28.98 
 
 
310 aa  105  9e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  30.68 
 
 
309 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  27.72 
 
 
309 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  30.68 
 
 
309 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
312 aa  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  28.53 
 
 
342 aa  104  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.45 
 
 
308 aa  104  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.24 
 
 
322 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  28.66 
 
 
316 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  29.1 
 
 
317 aa  103  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.28 
 
 
309 aa  103  5e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.04 
 
 
312 aa  102  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  29.67 
 
 
317 aa  102  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>