More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5016 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  100 
 
 		 321 aa  610  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  48.71 
 
 		 329 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  47.84 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  47.08 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  49.35 
 
 		 323 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  44.44 
 
 		 315 aa  203  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  50.77 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  48.37 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  40.97 
 
 		 317 aa  193  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  44.07 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  44.59 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  42.77 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  42.55 
 
 		 330 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  44.59 
 
 		 342 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  44 
 
 		 301 aa  177  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  42.04 
 
 		 340 aa  176  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  42.22 
 
 		 329 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  42.22 
 
 		 345 aa  176  7e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  42.26 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  41.31 
 
 		 311 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 		 319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  41.54 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  41.54 
 
 		 330 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.03 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  41.67 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  41.59 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  43.85 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  42.24 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  42.24 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  42.24 
 
 		 329 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  42.11 
 
 		 324 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  40.13 
 
 		 314 aa  169  8e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  42.31 
 
 		 328 aa  169  9e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.93 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  40.45 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  38.61 
 
 		 317 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  40.98 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  42.91 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  41.67 
 
 		 318 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  40.32 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  41.08 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  38.71 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  40.26 
 
 		 339 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  39.05 
 
 		 327 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  40.91 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  39.69 
 
 		 327 aa  155  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  40.58 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  42.24 
 
 		 326 aa  155  8e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  40.71 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  41.22 
 
 		 320 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.14 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  35.14 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  40.71 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  35.14 
 
 		 322 aa  146  6e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  37.91 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  41.8 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  37.01 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.84 
 
 		 313 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  37.23 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  34.27 
 
 		 306 aa  126  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.23 
 
 		 320 aa  125  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.63 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  35.59 
 
 		 311 aa  122  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.07 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  34.8 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  31.4 
 
 		 645 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  26.96 
 
 		 590 aa  119  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.46 
 
 		 329 aa  119  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.7 
 
 		 308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  37.66 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 316 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  35.84 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  27.81 
 
 		 342 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  32.46 
 
 		 642 aa  116  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  26.71 
 
 		 326 aa  116  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  36.04 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  33.21 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  33.21 
 
 		 308 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  33.91 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  33.71 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  30.6 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  36.04 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  25.81 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.65 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.57 
 
 		 311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  35.21 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.08 
 
 		 309 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.81 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  33.21 
 
 		 319 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.35 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  28.92 
 
 		 340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  30.42 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  27.18 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  32.13 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  30.24 
 
 		 343 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.97 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  36.55 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  32.49 
 
 		 319 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>