More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2438 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  100 
 
 		 323 aa  628  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  49.84 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  44.08 
 
 		 329 aa  210  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  49.35 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  45.48 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  44.93 
 
 		 301 aa  202  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  40.58 
 
 		 317 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  44.34 
 
 		 344 aa  201  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  43.23 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  44.67 
 
 		 314 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  46.43 
 
 		 315 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  46.46 
 
 		 321 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  47.12 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  45.51 
 
 		 318 aa  189  7e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  41.8 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  44.05 
 
 		 342 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  36.66 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  42.52 
 
 		 318 aa  172  5e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  41.33 
 
 		 291 aa  172  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  37.01 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  39.25 
 
 		 329 aa  169  4e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  37.58 
 
 		 314 aa  169  5e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  40.19 
 
 		 330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 		 340 aa  166  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  40.84 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  38.03 
 
 		 326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  41.81 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  39.35 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  40.19 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  41.12 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.12 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  41.12 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  41.42 
 
 		 314 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.12 
 
 		 329 aa  161  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  39.24 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  39.24 
 
 		 330 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.79 
 
 		 329 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  39.56 
 
 		 330 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  31.61 
 
 		 313 aa  160  3e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  40.71 
 
 		 318 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  40.51 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  38.56 
 
 		 317 aa  157  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  40.51 
 
 		 314 aa  156  4e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  35.53 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  36.82 
 
 		 306 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  39.54 
 
 		 315 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  36.08 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  39.87 
 
 		 316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  38.36 
 
 		 345 aa  153  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  37.13 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  37.91 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  30.61 
 
 		 590 aa  151  1e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  38.18 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  36.61 
 
 		 339 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 319 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  39.6 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  36.61 
 
 		 320 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  32.04 
 
 		 342 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  39.29 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  39.61 
 
 		 316 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  37.34 
 
 		 320 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  39.17 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 		 316 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  36.13 
 
 		 308 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  37.96 
 
 		 321 aa  139  7e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.47 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  35.77 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  37.04 
 
 		 317 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  36.77 
 
 		 308 aa  135  8e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  37.99 
 
 		 316 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  35.4 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  35.4 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.2 
 
 		 307 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  35.4 
 
 		 308 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  35.53 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  37.75 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  27.44 
 
 		 340 aa  132  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 316 aa  132  9e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.87 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  32.99 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  35.53 
 
 		 307 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.96 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  37.75 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  37.75 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  29.94 
 
 		 340 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  30.29 
 
 		 331 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  33.77 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  31.8 
 
 		 341 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  37.01 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.1 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  37.42 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  37.42 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  37.42 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.73 
 
 		 320 aa  128  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  37.42 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 642 aa  126  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 		 308 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  31.52 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.33 
 
 		 318 aa  125  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>