More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_2979 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  100 
 
 		 316 aa  630  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  95.89 
 
 		 316 aa  607  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  73.29 
 
 		 345 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  72.64 
 
 		 314 aa  445  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  71.52 
 
 		 316 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  70.89 
 
 		 316 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  70.89 
 
 		 316 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  71.34 
 
 		 316 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  64.38 
 
 		 328 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  62.75 
 
 		 329 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  61.56 
 
 		 327 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  59.34 
 
 		 327 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  61.36 
 
 		 330 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  60.39 
 
 		 330 aa  363  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  61.11 
 
 		 329 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  61.36 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  61.36 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  61.04 
 
 		 330 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  61.36 
 
 		 330 aa  361  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  61.11 
 
 		 329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  57.7 
 
 		 320 aa  350  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  60.46 
 
 		 329 aa  349  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  60.46 
 
 		 329 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  60.46 
 
 		 329 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  61.76 
 
 		 329 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  59.33 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  56.21 
 
 		 312 aa  338  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  59.68 
 
 		 324 aa  336  3.9999999999999995e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  55.41 
 
 		 314 aa  335  5.999999999999999e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  55.84 
 
 		 319 aa  334  1e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  55.52 
 
 		 315 aa  325  5e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  54.25 
 
 		 317 aa  322  6e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  53.92 
 
 		 340 aa  319  3.9999999999999996e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  48.22 
 
 		 319 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  37.5 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.42 
 
 		 320 aa  225  7e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  44.59 
 
 		 317 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.29 
 
 		 320 aa  211  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.07 
 
 		 270 aa  209  5e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  37.19 
 
 		 329 aa  169  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  38.92 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  37.01 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  39.27 
 
 		 344 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  37.25 
 
 		 329 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  37.62 
 
 		 339 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  36.65 
 
 		 319 aa  153  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  39.35 
 
 		 323 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  38.33 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  36.45 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  37.27 
 
 		 308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  38.11 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  39.41 
 
 		 318 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  36.16 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  37.42 
 
 		 314 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  37.34 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  39 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  35.22 
 
 		 311 aa  133  5e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  35.42 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  35.5 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  35.42 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  34.64 
 
 		 309 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  34.69 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  36.53 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  35.06 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  36.16 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  34.53 
 
 		 320 aa  125  9e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  36.16 
 
 		 308 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  40.32 
 
 		 321 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 327 aa  124  3e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  34.82 
 
 		 363 aa  123  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  35.42 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.43 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  32.26 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  32.26 
 
 		 308 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  27.81 
 
 		 313 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  36.01 
 
 		 342 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.55 
 
 		 291 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  34.67 
 
 		 311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.51 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  33.58 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.05 
 
 		 316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  32.81 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  36.53 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  36.53 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  36.53 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  34.32 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  30.12 
 
 		 347 aa  112  6e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.06 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  32.49 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.95 
 
 		 320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29 
 
 		 312 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  33.23 
 
 		 645 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  33.09 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  33.09 
 
 		 308 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  32.23 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  32.49 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  32.59 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>