More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0191 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  100 
 
 
309 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  99.35 
 
 
309 aa  636    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  100 
 
 
309 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  99.35 
 
 
309 aa  636    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  99.68 
 
 
309 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  99.35 
 
 
309 aa  637    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  100 
 
 
309 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  99.03 
 
 
309 aa  633  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  88.31 
 
 
309 aa  574  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  75.65 
 
 
310 aa  504  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  73.7 
 
 
310 aa  494  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  74.03 
 
 
310 aa  491  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  73.7 
 
 
310 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  73.94 
 
 
310 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  73.63 
 
 
314 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  73.63 
 
 
314 aa  478  1e-134  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  73.63 
 
 
314 aa  478  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  50.16 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  51.15 
 
 
311 aa  296  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  50.98 
 
 
307 aa  295  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.33 
 
 
307 aa  292  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  44.62 
 
 
312 aa  276  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  47.23 
 
 
314 aa  266  4e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.48 
 
 
322 aa  264  1e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  46.13 
 
 
312 aa  263  2e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.75 
 
 
331 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  47.62 
 
 
298 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  44.52 
 
 
312 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  43.09 
 
 
309 aa  252  5.000000000000001e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  43.32 
 
 
311 aa  249  5e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  46.33 
 
 
296 aa  248  8e-65  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.81 
 
 
318 aa  241  1e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  41.27 
 
 
326 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  42.67 
 
 
309 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  42.57 
 
 
311 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.97 
 
 
325 aa  215  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  41.39 
 
 
305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 
325 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  36.63 
 
 
313 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  40.73 
 
 
305 aa  204  1e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
310 aa  204  1e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  37.09 
 
 
307 aa  204  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  43.8 
 
 
258 aa  202  5e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.4 
 
 
305 aa  202  6e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  39.37 
 
 
306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  39.8 
 
 
290 aa  192  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  37.86 
 
 
315 aa  192  5e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.7 
 
 
304 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.33 
 
 
312 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  37.66 
 
 
325 aa  186  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  33.33 
 
 
318 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 
305 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  37.34 
 
 
306 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.33 
 
 
295 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  40.46 
 
 
302 aa  170  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  39.02 
 
 
302 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  34.87 
 
 
311 aa  166  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.22 
 
 
299 aa  159  6e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.09 
 
 
304 aa  156  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  37.05 
 
 
297 aa  149  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  34.53 
 
 
312 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.82 
 
 
250 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  32 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  32.39 
 
 
311 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.29 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  29.18 
 
 
308 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  29.18 
 
 
308 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  30.58 
 
 
316 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  31.54 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  31.54 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 
308 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  30.22 
 
 
308 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  38.67 
 
 
153 aa  106  6e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  29.43 
 
 
309 aa  105  7e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  30.68 
 
 
314 aa  105  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  29.96 
 
 
308 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  27.64 
 
 
308 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  30.82 
 
 
321 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  25.24 
 
 
313 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.1 
 
 
329 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  33.59 
 
 
323 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  30.39 
 
 
308 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  30.39 
 
 
308 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 
308 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.64 
 
 
329 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 
308 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  29.72 
 
 
309 aa  99.8  5e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  30.32 
 
 
308 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  30.32 
 
 
308 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  29.64 
 
 
329 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  31.05 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  30.32 
 
 
308 aa  99  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  31.05 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  31.05 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  31.05 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 
319 aa  98.2  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.67 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  28.67 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
324 aa  98.2  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>