More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1358 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 
291 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  45.78 
 
 
321 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  43.23 
 
 
320 aa  181  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  38.49 
 
 
329 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  40.85 
 
 
311 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  39.27 
 
 
314 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  41.33 
 
 
323 aa  162  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  36.48 
 
 
317 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  37.46 
 
 
318 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  42.14 
 
 
327 aa  144  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  38.61 
 
 
315 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  36.1 
 
 
328 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  34.44 
 
 
314 aa  138  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  36.1 
 
 
327 aa  136  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  36.28 
 
 
329 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  35.78 
 
 
330 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  36.62 
 
 
327 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.3 
 
 
329 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  36.91 
 
 
344 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 
316 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.3 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 
330 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  37.3 
 
 
329 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.61 
 
 
322 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  37.3 
 
 
329 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 
330 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  32.35 
 
 
319 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  36.84 
 
 
316 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.98 
 
 
329 aa  129  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  35.14 
 
 
320 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  35.02 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 
330 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  37.93 
 
 
342 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  34.7 
 
 
329 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  33.56 
 
 
301 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 
319 aa  123  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  34.56 
 
 
301 aa  123  5e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  37.73 
 
 
339 aa  122  7e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  33.55 
 
 
345 aa  122  9e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  34.22 
 
 
306 aa  122  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  34.23 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  35.37 
 
 
314 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  39.34 
 
 
321 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
324 aa  119  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  33.55 
 
 
316 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  34.41 
 
 
343 aa  118  9e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  36.66 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  33.55 
 
 
316 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  33.12 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  32.03 
 
 
312 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.99 
 
 
319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  26.28 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  35.03 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  32.25 
 
 
314 aa  113  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  36.13 
 
 
316 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  38.82 
 
 
326 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.89 
 
 
313 aa  106  5e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.57 
 
 
308 aa  104  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  26.28 
 
 
338 aa  99.8  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  30.32 
 
 
317 aa  99  9e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  33.68 
 
 
320 aa  96.3  5e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  24.36 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  26.88 
 
 
332 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  27.45 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  29.71 
 
 
315 aa  94.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  26.52 
 
 
332 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  26.52 
 
 
332 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  26.52 
 
 
332 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  31.15 
 
 
321 aa  93.2  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  26.16 
 
 
332 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  30.37 
 
 
317 aa  92  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.88 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  23.13 
 
 
299 aa  90.9  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  33.08 
 
 
363 aa  88.6  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  27.01 
 
 
338 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30.85 
 
 
304 aa  86.7  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  31.44 
 
 
308 aa  86.3  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.55 
 
 
304 aa  85.5  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.59 
 
 
333 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  32.9 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  32.1 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.43 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  28.15 
 
 
317 aa  82.8  0.000000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  30.96 
 
 
332 aa  82  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  30.96 
 
 
645 aa  82.4  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 
313 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  31.11 
 
 
325 aa  81.6  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  31.34 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  28.26 
 
 
324 aa  80.9  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.42 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.41 
 
 
320 aa  80.9  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  22.56 
 
 
311 aa  79.7  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.31 
 
 
315 aa  79.7  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  32.64 
 
 
319 aa  79.3  0.00000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  26.64 
 
 
320 aa  79.3  0.00000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>