More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5056 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  100 
 
 		 320 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  57.41 
 
 		 344 aa  305  6e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  53.9 
 
 		 342 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  53.97 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  48.75 
 
 		 318 aa  230  3e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  49.84 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  45.93 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  50.48 
 
 		 327 aa  215  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  43.42 
 
 		 317 aa  212  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  48.34 
 
 		 314 aa  205  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  46.5 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  47.84 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  43.67 
 
 		 301 aa  188  9e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  37.22 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  42.36 
 
 		 326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  40.89 
 
 		 314 aa  182  9.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.23 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  40.84 
 
 		 316 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  48.94 
 
 		 321 aa  179  8e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  42.62 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  39.94 
 
 		 317 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  40.92 
 
 		 319 aa  176  5e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 		 316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  32.25 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  40.4 
 
 		 339 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 340 aa  172  5.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  40.19 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  37.3 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 		 320 aa  167  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  38.87 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  38.92 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  44.04 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  38.39 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  38.31 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  40.57 
 
 		 324 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  37.54 
 
 		 327 aa  161  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  41.88 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 		 315 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  38.92 
 
 		 314 aa  159  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  37.46 
 
 		 345 aa  159  7e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  39.42 
 
 		 314 aa  159  8e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 		 322 aa  158  1e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  37.38 
 
 		 327 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.26 
 
 		 329 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  39.87 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  39.54 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.54 
 
 		 329 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  39.68 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  39.68 
 
 		 330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.05 
 
 		 330 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  40.13 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  38.01 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  37.74 
 
 		 330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  39.68 
 
 		 330 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  35.62 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.22 
 
 		 329 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  37.94 
 
 		 328 aa  151  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  37.05 
 
 		 318 aa  151  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  36.62 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.23 
 
 		 320 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  39.55 
 
 		 329 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  40.51 
 
 		 343 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  36.86 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  36.26 
 
 		 645 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  39.23 
 
 		 363 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  34.13 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  36.49 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  36.57 
 
 		 329 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.15 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  34.34 
 
 		 642 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.84 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  29.38 
 
 		 326 aa  133  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  33.67 
 
 		 321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  35.8 
 
 		 339 aa  130  3e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  33.22 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  33.1 
 
 		 320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  31.79 
 
 		 342 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.34 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  31.5 
 
 		 342 aa  125  9e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  40.29 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  32.05 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3036  PfkB  34.72 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  31.53 
 
 		 343 aa  122  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  28.99 
 
 		 340 aa  122  9e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  26.95 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  35.53 
 
 		 316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.21 
 
 		 270 aa  121  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  29.13 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  35.02 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  27.96 
 
 		 590 aa  118  9.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  31.58 
 
 		 645 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  31.11 
 
 		 645 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  36.69 
 
 		 309 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  37.55 
 
 		 319 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  32.2 
 
 		 321 aa  116  5e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.85 
 
 		 340 aa  115  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  26.27 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  33.33 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>