More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3036 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3036  PfkB  100 
 
 
342 aa  676    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3516  ribokinase-like domain-containing protein  59.82 
 
 
336 aa  363  3e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.300255  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  52.82 
 
 
339 aa  294  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03455  2-keto-3-deoxygluconate kinase  49.7 
 
 
340 aa  269  5.9999999999999995e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1699  ribokinase-like domain-containing protein  49.24 
 
 
329 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1057  PfkB domain protein  38.8 
 
 
330 aa  231  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.443238  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  38.34 
 
 
331 aa  219  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11458  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.26 
 
 
341 aa  206  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.216935  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2739  ribokinase-like domain-containing protein  36.42 
 
 
343 aa  203  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000138473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  36.47 
 
 
340 aa  203  4e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4261  ribokinase-like domain-containing protein  34.05 
 
 
348 aa  200  3e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  35.42 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2044  PfkB domain protein  31.56 
 
 
340 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0945186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  35.12 
 
 
339 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  31.86 
 
 
340 aa  189  7e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  32.01 
 
 
590 aa  188  9e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1598  PfkB domain protein  34.02 
 
 
341 aa  183  4.0000000000000006e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1160  PfkB domain protein  35.6 
 
 
342 aa  181  1e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  33.95 
 
 
342 aa  182  1e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1379  PfkB domain protein  32.46 
 
 
340 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2275  PfkB domain protein  35.58 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0697  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.66 
 
 
341 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  31.8 
 
 
331 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4058  PfkB domain protein  30.52 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.54 
 
 
334 aa  172  9e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0674  PfkB domain protein  30.41 
 
 
337 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3346  PfkB domain protein  34.69 
 
 
351 aa  170  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1329  2-keto-3-deoxygluconate kinase  32.53 
 
 
342 aa  169  6e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2264  PfkB domain protein  32.65 
 
 
331 aa  167  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.123147 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2644  PfkB  33.23 
 
 
334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0669  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 
343 aa  163  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6831  PfkB domain protein  33.84 
 
 
332 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.743211 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0398  PfkB family kinase  30.31 
 
 
339 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4686  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 
338 aa  153  5e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4972  carbohydrate kinase, PfkB family  31.72 
 
 
338 aa  152  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4985  carbohydrate kinase, PfkB family  31.42 
 
 
338 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0263  carbohydrate kinase, PfkB family  30.61 
 
 
338 aa  149  6e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.957258  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5000  carbohydrate kinase  31.12 
 
 
338 aa  149  8e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0394  ribokinase family sugar kinase  29.38 
 
 
339 aa  149  9e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4577  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.7 
 
 
338 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4596  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.12 
 
 
338 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4737  carbohydrate kinase  30.7 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5097  carbohydrate kinase  30.7 
 
 
338 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1246  PfkB domain protein  30.38 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.463266  normal  0.070655 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4957  carbohydrate kinase, PfkB family  30.4 
 
 
338 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  29.07 
 
 
344 aa  143  5e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3191  PfkB domain protein  29.19 
 
 
366 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000772988  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  32.34 
 
 
321 aa  140  3e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  30.59 
 
 
338 aa  139  7e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  30.93 
 
 
317 aa  138  1e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  31.63 
 
 
317 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  28.82 
 
 
317 aa  135  8e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  30.25 
 
 
326 aa  135  9e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1906  carbohydrate kinase  28.25 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  32.74 
 
 
318 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.23 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27180  sugar kinase, ribokinase  31.71 
 
 
372 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.771219  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  35.8 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  31.33 
 
 
332 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2208  PfkB domain protein  32 
 
 
366 aa  125  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4259  ribokinase-like domain-containing protein  28.33 
 
 
365 aa  125  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0227  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 
353 aa  123  5e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3010  PfkB domain protein  32.56 
 
 
365 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489686  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0202  PfkB domain protein  32.94 
 
 
359 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0709042  normal  0.0337983 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2098  PfkB domain protein  29.74 
 
 
360 aa  115  7.999999999999999e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0908  PfkB domain protein  30.77 
 
 
367 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.288989  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1761  ribokinase-like domain-containing protein  26.74 
 
 
368 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550108  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  32.43 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  44.51 
 
 
323 aa  108  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  26.36 
 
 
321 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0377  PfkB domain protein  29.71 
 
 
319 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.404819  normal  0.365266 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
329 aa  103  3e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.26 
 
 
317 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  33.85 
 
 
342 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0006  PfkB domain protein  29.1 
 
 
312 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.997573  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  28.83 
 
 
306 aa  98.6  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.8 
 
 
317 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  32.88 
 
 
301 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  33.56 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 
301 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  33.68 
 
 
319 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  33.56 
 
 
339 aa  92.8  7e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  33.02 
 
 
318 aa  92.8  7e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  40 
 
 
327 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  29.23 
 
 
330 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  29.23 
 
 
330 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  29.23 
 
 
330 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2815  PfkB  33.44 
 
 
314 aa  91.7  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  35.25 
 
 
363 aa  89.4  9e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  32.15 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  32.25 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  27.03 
 
 
322 aa  88.2  2e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  28.22 
 
 
330 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  30.41 
 
 
314 aa  86.3  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  40 
 
 
321 aa  86.3  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 
314 aa  86.3  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  35.14 
 
 
320 aa  85.9  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  38.2 
 
 
321 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  29.63 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  26.14 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>