More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3500 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  55.59 
 
 		 642 aa  698    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  55.32 
 
 		 659 aa  696    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  54.27 
 
 		 650 aa  684    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  100 
 
 		 645 aa  1319    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  62.7 
 
 		 666 aa  786    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  55.99 
 
 		 634 aa  717    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  94.26 
 
 		 645 aa  1250    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  62.7 
 
 		 666 aa  786    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  55.19 
 
 		 651 aa  689    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  55.97 
 
 		 652 aa  700    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  55.91 
 
 		 625 aa  709    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  62.85 
 
 		 666 aa  809    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  65.94 
 
 		 681 aa  871    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  65.63 
 
 		 680 aa  864    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  64.3 
 
 		 670 aa  862    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  55.19 
 
 		 651 aa  686    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  62.7 
 
 		 666 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  55.5 
 
 		 651 aa  688    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  80.31 
 
 		 647 aa  1098    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  55.47 
 
 		 656 aa  723    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  62.54 
 
 		 666 aa  784    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  53.21 
 
 		 636 aa  693    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  55.4 
 
 		 646 aa  703    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  55.66 
 
 		 651 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  56.15 
 
 		 634 aa  719    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  54.57 
 
 		 651 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  62.7 
 
 		 666 aa  786    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  55.5 
 
 		 651 aa  688    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  54.04 
 
 		 643 aa  707    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  56.41 
 
 		 647 aa  729    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  55.16 
 
 		 654 aa  719    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  62.7 
 
 		 666 aa  785    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  62.7 
 
 		 666 aa  786    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  53.21 
 
 		 674 aa  679    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  53.74 
 
 		 652 aa  717    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  50.39 
 
 		 642 aa  612  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  47.96 
 
 		 634 aa  590  1e-167  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  47.33 
 
 		 644 aa  575  1.0000000000000001e-163  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  46.93 
 
 		 644 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  46.6 
 
 		 655 aa  569  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  47.34 
 
 		 633 aa  568  1e-160  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  46.55 
 
 		 646 aa  561  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  47.29 
 
 		 636 aa  561  1e-158  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  46.13 
 
 		 645 aa  558  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  46.69 
 
 		 640 aa  545  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  47.56 
 
 		 635 aa  545  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  38.93 
 
 		 630 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  47.8 
 
 		 628 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  47.25 
 
 		 628 aa  323  4e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  35.96 
 
 		 335 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  35.95 
 
 		 337 aa  184  3e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  33.53 
 
 		 332 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  33.53 
 
 		 332 aa  180  9e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  33.53 
 
 		 332 aa  180  9e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  33.53 
 
 		 332 aa  179  1e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  36.72 
 
 		 322 aa  177  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  33.82 
 
 		 332 aa  174  5e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  35.29 
 
 		 327 aa  172  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  36.04 
 
 		 336 aa  169  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  35.65 
 
 		 322 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 		 364 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  36.92 
 
 		 312 aa  162  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  32.75 
 
 		 333 aa  160  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  32.43 
 
 		 317 aa  156  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 323 aa  154  7e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  33.13 
 
 		 349 aa  154  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  35.14 
 
 		 317 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.56 
 
 		 338 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  35.49 
 
 		 320 aa  151  4e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  33.93 
 
 		 321 aa  150  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  31.72 
 
 		 338 aa  148  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  33.84 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  34.12 
 
 		 325 aa  145  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  33.33 
 
 		 326 aa  144  6e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  32.92 
 
 		 314 aa  143  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  31.4 
 
 		 324 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  32.61 
 
 		 314 aa  142  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  30.45 
 
 		 338 aa  140  7.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  34.76 
 
 		 321 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 		 326 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 323 aa  127  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.6 
 
 		 323 aa  125  4e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 		 322 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 		 322 aa  122  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  31.11 
 
 		 320 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.78 
 
 		 323 aa  113  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.81 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  31.07 
 
 		 317 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.16 
 
 		 320 aa  109  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.69 
 
 		 329 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  27.35 
 
 		 324 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  29.32 
 
 		 314 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.69 
 
 		 315 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  24.23 
 
 		 323 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.03 
 
 		 333 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  26.73 
 
 		 333 aa  104  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  27.94 
 
 		 327 aa  104  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  29.25 
 
 		 345 aa  104  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  27.78 
 
 		 317 aa  103  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  27.8 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>