More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1088 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  100 
 
 
315 aa  648    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  44.3 
 
 
311 aa  269  5e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  36.67 
 
 
320 aa  199  7e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  30.25 
 
 
645 aa  145  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0447  ribokinase-like domain-containing protein  34.31 
 
 
301 aa  142  6e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  27.54 
 
 
307 aa  142  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  30.86 
 
 
324 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  30.86 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  29.67 
 
 
323 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.48 
 
 
333 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  29.84 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0534  ribokinase-like domain-containing protein  30.11 
 
 
293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.690237  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  31.19 
 
 
341 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  31.11 
 
 
329 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  29.74 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 
326 aa  127  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  30.48 
 
 
325 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  31.14 
 
 
327 aa  126  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.48 
 
 
347 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.87 
 
 
319 aa  124  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.97 
 
 
322 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  29.27 
 
 
319 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  28.52 
 
 
319 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.07 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  28.52 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  30.94 
 
 
322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  30.91 
 
 
319 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  28.81 
 
 
630 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.96 
 
 
306 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
635 aa  119  7.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.04 
 
 
322 aa  119  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  29.79 
 
 
319 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.01 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.07 
 
 
316 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28 
 
 
319 aa  116  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
636 aa  115  6.9999999999999995e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.63 
 
 
323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  29.21 
 
 
633 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  27.97 
 
 
655 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.01 
 
 
308 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.76 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.76 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.76 
 
 
313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.2 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.77 
 
 
307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  30.85 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  32.13 
 
 
316 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  28.06 
 
 
322 aa  110  3e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  31.2 
 
 
323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 
319 aa  109  5e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.79 
 
 
337 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.8 
 
 
642 aa  109  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 
646 aa  109  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  27.19 
 
 
647 aa  109  7.000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  32.71 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  26.38 
 
 
647 aa  108  8.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  27.3 
 
 
645 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.82 
 
 
313 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.04 
 
 
319 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  31.77 
 
 
316 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.76 
 
 
313 aa  108  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  31.74 
 
 
320 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  26.77 
 
 
656 aa  107  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  28.66 
 
 
640 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  26.69 
 
 
645 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.69 
 
 
323 aa  107  4e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  26.77 
 
 
654 aa  107  4e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  31.77 
 
 
316 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  27.16 
 
 
634 aa  105  9e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.33 
 
 
311 aa  105  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  30.86 
 
 
306 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  31.33 
 
 
344 aa  104  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  29.13 
 
 
339 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  30.64 
 
 
311 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  26.55 
 
 
306 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  24.91 
 
 
315 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  27.36 
 
 
625 aa  104  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  23.92 
 
 
332 aa  103  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  26.3 
 
 
634 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 
319 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 
319 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  24.53 
 
 
628 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  29.45 
 
 
317 aa  103  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  24.91 
 
 
315 aa  103  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  29.63 
 
 
319 aa  103  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  28.03 
 
 
317 aa  103  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  31.63 
 
 
319 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  24.5 
 
 
312 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  23.59 
 
 
332 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  23.59 
 
 
332 aa  102  7e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  23.59 
 
 
332 aa  102  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  25.71 
 
 
364 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  24.45 
 
 
628 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  29.66 
 
 
304 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  28.72 
 
 
303 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  28.51 
 
 
311 aa  101  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  29.23 
 
 
340 aa  100  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2365  PfkB domain-containing protein  28.89 
 
 
313 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  31.39 
 
 
311 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>