More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2996 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  56.99 
 
 		 650 aa  702    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  55.99 
 
 		 645 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  54.82 
 
 		 670 aa  717    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  57.41 
 
 		 666 aa  696    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  78.65 
 
 		 625 aa  1030    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  54.57 
 
 		 645 aa  702    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  60.28 
 
 		 652 aa  811    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  57.41 
 
 		 666 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  57.41 
 
 		 652 aa  702    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  54.65 
 
 		 659 aa  684    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  55.99 
 
 		 681 aa  717    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  57.03 
 
 		 651 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  57.26 
 
 		 666 aa  694    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  70.57 
 
 		 642 aa  905    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  78.52 
 
 		 654 aa  1050    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  57.41 
 
 		 666 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  57.37 
 
 		 666 aa  708    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  55.84 
 
 		 680 aa  716    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  52.62 
 
 		 633 aa  642    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  57.41 
 
 		 666 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  56.78 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  53.27 
 
 		 634 aa  664    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  56.29 
 
 		 651 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  100 
 
 		 634 aa  1308    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  68.61 
 
 		 636 aa  940    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  68.99 
 
 		 643 aa  909    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  57.41 
 
 		 666 aa  696    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  56.87 
 
 		 651 aa  693    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  56.78 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  53.07 
 
 		 646 aa  635    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  56.78 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  81.76 
 
 		 647 aa  1084    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  78.67 
 
 		 656 aa  1052    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  57.73 
 
 		 647 aa  735    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  55.73 
 
 		 646 aa  707    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  57.41 
 
 		 666 aa  696    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  54.43 
 
 		 674 aa  687    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  97.79 
 
 		 634 aa  1281    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  52.62 
 
 		 640 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  51.51 
 
 		 636 aa  620  1e-176  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  49.28 
 
 		 642 aa  613  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  52.62 
 
 		 635 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  47.72 
 
 		 644 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  47.3 
 
 		 644 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  46.21 
 
 		 645 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  46.92 
 
 		 655 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  40.26 
 
 		 630 aa  464  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  47.91 
 
 		 628 aa  326  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  46.8 
 
 		 628 aa  320  5e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  36.7 
 
 		 327 aa  187  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  34.97 
 
 		 337 aa  185  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.37 
 
 		 335 aa  183  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  32.84 
 
 		 332 aa  176  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  31.58 
 
 		 332 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  31.58 
 
 		 332 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  31.95 
 
 		 332 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  32.25 
 
 		 332 aa  172  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  37.12 
 
 		 322 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  36.14 
 
 		 336 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 323 aa  167  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  32.73 
 
 		 317 aa  164  3e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  34.73 
 
 		 364 aa  164  7e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  34.66 
 
 		 312 aa  158  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  34.94 
 
 		 322 aa  157  8e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  34.21 
 
 		 338 aa  156  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  33.53 
 
 		 349 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  32.42 
 
 		 314 aa  153  8.999999999999999e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  35.91 
 
 		 314 aa  153  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  33.74 
 
 		 321 aa  151  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.21 
 
 		 338 aa  150  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  33.84 
 
 		 320 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  33.94 
 
 		 320 aa  147  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  31.42 
 
 		 333 aa  146  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  34.04 
 
 		 321 aa  146  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 326 aa  144  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  33.73 
 
 		 325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  32.84 
 
 		 317 aa  131  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  27.94 
 
 		 338 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  30.45 
 
 		 324 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.45 
 
 		 323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  31.42 
 
 		 326 aa  127  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 322 aa  128  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  33.93 
 
 		 323 aa  125  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.36 
 
 		 329 aa  123  8e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.3 
 
 		 323 aa  121  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.36 
 
 		 322 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  24.62 
 
 		 314 aa  114  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.88 
 
 		 337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  27.11 
 
 		 317 aa  107  7e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  23.48 
 
 		 321 aa  107  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.14 
 
 		 307 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.69 
 
 		 306 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  25.08 
 
 		 308 aa  104  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.44 
 
 		 313 aa  103  8e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 311 aa  103  8e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  26.01 
 
 		 311 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  28 
 
 		 339 aa  101  4e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  25.82 
 
 		 325 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  25.88 
 
 		 324 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.23 
 
 		 315 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>