More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5700 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  100 
 
 		 335 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  56.93 
 
 		 337 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 633 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  35.61 
 
 		 634 aa  210  3e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  36.23 
 
 		 674 aa  206  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  35.57 
 
 		 655 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  35.28 
 
 		 636 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  35.14 
 
 		 636 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  36.23 
 
 		 659 aa  199  7.999999999999999e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  33.53 
 
 		 628 aa  199  7.999999999999999e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  33.92 
 
 		 628 aa  198  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  37.06 
 
 		 647 aa  195  8.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  35.17 
 
 		 646 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  33.82 
 
 		 644 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  33.62 
 
 		 644 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  37.32 
 
 		 652 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  35.88 
 
 		 645 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  36.05 
 
 		 650 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  35.96 
 
 		 645 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  37.04 
 
 		 651 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  37.04 
 
 		 651 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  37.04 
 
 		 651 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  34.01 
 
 		 635 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  31.1 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  31.1 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  31.1 
 
 		 332 aa  188  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  33.14 
 
 		 640 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  33.43 
 
 		 647 aa  187  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  32.66 
 
 		 642 aa  186  5e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  36.92 
 
 		 651 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  31.1 
 
 		 332 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  33.43 
 
 		 643 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 		 656 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  31.21 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 652 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  36.02 
 
 		 646 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 		 651 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  32.27 
 
 		 634 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  32.37 
 
 		 634 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  32.08 
 
 		 654 aa  182  6e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  35.04 
 
 		 651 aa  182  6e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 670 aa  181  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  32.93 
 
 		 642 aa  180  2.9999999999999997e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  34.99 
 
 		 681 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  32.35 
 
 		 625 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  35.67 
 
 		 680 aa  178  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  34.4 
 
 		 645 aa  176  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  33.43 
 
 		 336 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  28.75 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  32.1 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  35.09 
 
 		 666 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  34.24 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  34.8 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  34.8 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  34.8 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  34.8 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  34.8 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  34.8 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  34.8 
 
 		 666 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  28.4 
 
 		 338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  31.1 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  32.01 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 349 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  34.77 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  32.02 
 
 		 630 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 		 320 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 		 364 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  29.57 
 
 		 324 aa  152  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  32.32 
 
 		 312 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  28.19 
 
 		 338 aa  145  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  29.94 
 
 		 333 aa  143  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  31.58 
 
 		 321 aa  142  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  32.33 
 
 		 325 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  30.45 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  32.01 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  30.27 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.09 
 
 		 320 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  29.73 
 
 		 326 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  24.85 
 
 		 319 aa  116  6e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 		 319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  26.61 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.62 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  31.27 
 
 		 323 aa  108  9.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2528  protein IolC  29 
 
 		 207 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000240198 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.91 
 
 		 308 aa  107  3e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  28.82 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  25.44 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  26.16 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  24.77 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.25 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  26.1 
 
 		 319 aa  99.4  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  24.71 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.19 
 
 		 323 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  27.54 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  26.35 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  25.76 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.23 
 
 		 317 aa  96.3  7e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  25.07 
 
 		 322 aa  95.9  8e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>