More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0985 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  64.04 
 
 		 650 aa  812    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  64.38 
 
 		 651 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  55.32 
 
 		 645 aa  696    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  55.66 
 
 		 666 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  55.66 
 
 		 666 aa  673    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  54.39 
 
 		 645 aa  686    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  55.66 
 
 		 666 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  63.91 
 
 		 652 aa  798    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  56.4 
 
 		 666 aa  698    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  54.65 
 
 		 634 aa  683    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  55.66 
 
 		 666 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  55.66 
 
 		 680 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  54.63 
 
 		 647 aa  672    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 659 aa  1322    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  53.57 
 
 		 642 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  54.88 
 
 		 670 aa  683    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  64.38 
 
 		 651 aa  801    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  63.28 
 
 		 651 aa  770    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  52.76 
 
 		 654 aa  644    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  51.1 
 
 		 636 aa  644    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  63.75 
 
 		 651 aa  787    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  63.28 
 
 		 651 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  54.65 
 
 		 634 aa  684    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  55.66 
 
 		 666 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  64.38 
 
 		 651 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  53.06 
 
 		 643 aa  659    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  55.81 
 
 		 681 aa  685    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  55.66 
 
 		 666 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  52.91 
 
 		 656 aa  645    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  55.16 
 
 		 647 aa  696    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  64.44 
 
 		 646 aa  835    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  55.66 
 
 		 666 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  61.85 
 
 		 674 aa  793    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  53.04 
 
 		 625 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  48.91 
 
 		 652 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  45.96 
 
 		 634 aa  534  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  46.46 
 
 		 655 aa  530  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  44.96 
 
 		 644 aa  531  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  44.65 
 
 		 644 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  45.26 
 
 		 633 aa  522  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  46.77 
 
 		 642 aa  521  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  47.39 
 
 		 646 aa  512  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  46.47 
 
 		 635 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  46.25 
 
 		 636 aa  491  1e-137  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  44.68 
 
 		 645 aa  490  1e-137  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  46.2 
 
 		 640 aa  488  1e-136  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  38.94 
 
 		 630 aa  395  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  46.72 
 
 		 628 aa  295  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  45.89 
 
 		 628 aa  291  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  36.23 
 
 		 335 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  33.92 
 
 		 332 aa  184  3e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  33.92 
 
 		 332 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  33.92 
 
 		 332 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  33.92 
 
 		 332 aa  184  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  33.63 
 
 		 332 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  37.77 
 
 		 327 aa  170  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  38.6 
 
 		 336 aa  166  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  34.59 
 
 		 337 aa  165  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 349 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  36.39 
 
 		 323 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  35.67 
 
 		 322 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  35.6 
 
 		 317 aa  151  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  27.57 
 
 		 338 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  35.06 
 
 		 364 aa  148  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  30.03 
 
 		 338 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  37.12 
 
 		 322 aa  141  3.9999999999999997e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  36.23 
 
 		 320 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  36 
 
 		 321 aa  139  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  34.47 
 
 		 314 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  28.86 
 
 		 333 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  35.67 
 
 		 312 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  35.49 
 
 		 320 aa  134  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 321 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.71 
 
 		 326 aa  131  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  32.28 
 
 		 338 aa  131  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  31.14 
 
 		 324 aa  130  9.000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  33.73 
 
 		 317 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  30.09 
 
 		 326 aa  124  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 322 aa  123  9.999999999999999e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 314 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  33.44 
 
 		 325 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  30.61 
 
 		 316 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  31.72 
 
 		 330 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.24 
 
 		 323 aa  110  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  32.02 
 
 		 330 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.89 
 
 		 317 aa  110  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  32.02 
 
 		 330 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  31.83 
 
 		 314 aa  109  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 		 330 aa  108  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  28.28 
 
 		 319 aa  108  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  30.86 
 
 		 330 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  31.64 
 
 		 330 aa  106  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  31.16 
 
 		 328 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.05 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.03 
 
 		 329 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2527  putative iolC protein  40.94 
 
 		 132 aa  104  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000173786 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.27 
 
 		 325 aa  104  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  29 
 
 		 320 aa  104  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  30.03 
 
 		 329 aa  104  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  29.59 
 
 		 316 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>