More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1240 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  56.99 
 
 		 634 aa  717    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  53.31 
 
 		 643 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  100 
 
 		 650 aa  1310    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  88.77 
 
 		 651 aa  1103    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  54.62 
 
 		 645 aa  699    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  55.85 
 
 		 656 aa  700    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  57.28 
 
 		 666 aa  670    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  54.31 
 
 		 645 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  57.28 
 
 		 666 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  88.14 
 
 		 652 aa  1115    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  88.3 
 
 		 651 aa  1118    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  56.96 
 
 		 634 aa  719    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  54.64 
 
 		 681 aa  677    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  55.23 
 
 		 670 aa  688    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  57.06 
 
 		 666 aa  692    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  57.28 
 
 		 666 aa  671    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  57.28 
 
 		 666 aa  670    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  54.49 
 
 		 680 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  88.3 
 
 		 651 aa  1117    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  88.46 
 
 		 651 aa  1124    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  64.04 
 
 		 659 aa  828    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  55.69 
 
 		 654 aa  699    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  53.82 
 
 		 636 aa  686    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  88.3 
 
 		 651 aa  1122    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  57.28 
 
 		 666 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  56.19 
 
 		 625 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  55.69 
 
 		 647 aa  702    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  88.3 
 
 		 651 aa  1117    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  55.19 
 
 		 647 aa  703    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  77.92 
 
 		 646 aa  1014    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  57.28 
 
 		 666 aa  670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  79.85 
 
 		 674 aa  1059    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  53.79 
 
 		 642 aa  653    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  57.28 
 
 		 666 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 652 aa  625  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  48.36 
 
 		 634 aa  571  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  47.16 
 
 		 633 aa  552  1e-156  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  45.51 
 
 		 644 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  48.15 
 
 		 636 aa  538  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  45.2 
 
 		 644 aa  535  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  46.14 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  46.59 
 
 		 642 aa  529  1e-149  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  48.42 
 
 		 635 aa  528  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  46.91 
 
 		 646 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  47.87 
 
 		 640 aa  524  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  45.35 
 
 		 645 aa  525  1e-147  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  40.89 
 
 		 630 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  49.15 
 
 		 628 aa  322  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  48.86 
 
 		 628 aa  320  7e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  36.63 
 
 		 335 aa  200  7e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  33.05 
 
 		 332 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  33.05 
 
 		 332 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  33.05 
 
 		 332 aa  194  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  33.05 
 
 		 332 aa  194  6e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  32.39 
 
 		 332 aa  189  1e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  36.63 
 
 		 337 aa  186  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  37.2 
 
 		 322 aa  170  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  35.91 
 
 		 327 aa  166  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  31.64 
 
 		 338 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  36.68 
 
 		 336 aa  163  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  36.09 
 
 		 323 aa  157  8e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  37.73 
 
 		 312 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  35.19 
 
 		 317 aa  153  7e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  38.34 
 
 		 322 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  33.74 
 
 		 364 aa  148  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  28.7 
 
 		 338 aa  145  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  35.26 
 
 		 320 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  31.74 
 
 		 324 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  34.24 
 
 		 338 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  34.05 
 
 		 349 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 321 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  36.62 
 
 		 321 aa  138  3.0000000000000003e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  29.88 
 
 		 333 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  35.09 
 
 		 314 aa  136  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  33.13 
 
 		 314 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  33.54 
 
 		 317 aa  133  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  36.31 
 
 		 320 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.06 
 
 		 323 aa  126  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.88 
 
 		 326 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  34.86 
 
 		 325 aa  119  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  29.57 
 
 		 326 aa  118  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.74 
 
 		 323 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 		 322 aa  115  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.58 
 
 		 317 aa  113  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.03 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.51 
 
 		 322 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.69 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  30.19 
 
 		 306 aa  107  6e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  27.62 
 
 		 315 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  35.85 
 
 		 323 aa  105  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.97 
 
 		 306 aa  105  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  29.76 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.35 
 
 		 323 aa  102  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.19 
 
 		 325 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  29.48 
 
 		 314 aa  101  5e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 314 aa  101  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2527  putative iolC protein  40.32 
 
 		 132 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000173786 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.62 
 
 		 317 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  24.92 
 
 		 314 aa  100  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 319 aa  99.8  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>