More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4059 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  100 
 
 		 325 aa  649    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  75.32 
 
 		 317 aa  488  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  69.78 
 
 		 321 aa  425  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  67.7 
 
 		 336 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  66.56 
 
 		 322 aa  415  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  65.23 
 
 		 323 aa  411  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  65.92 
 
 		 314 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  69.55 
 
 		 320 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  66.56 
 
 		 314 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  63.49 
 
 		 327 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  60.31 
 
 		 364 aa  377  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  60.94 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  62.15 
 
 		 349 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  60.95 
 
 		 312 aa  359  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  64.8 
 
 		 322 aa  356  2.9999999999999997e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  64.1 
 
 		 320 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  63.78 
 
 		 321 aa  345  7e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  54.46 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  47.96 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  35.05 
 
 		 628 aa  186  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  34.76 
 
 		 628 aa  185  8e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  35.84 
 
 		 337 aa  172  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.93 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  35.76 
 
 		 647 aa  166  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  34.23 
 
 		 636 aa  164  1.0000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  36.7 
 
 		 646 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  33.93 
 
 		 645 aa  164  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  33.33 
 
 		 645 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  34.73 
 
 		 681 aa  163  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  36.45 
 
 		 635 aa  163  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  36.5 
 
 		 645 aa  162  9e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  35.78 
 
 		 640 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  34.91 
 
 		 634 aa  162  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  35.33 
 
 		 647 aa  160  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  35.03 
 
 		 680 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  34.44 
 
 		 643 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  34.83 
 
 		 633 aa  158  1e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  34.02 
 
 		 634 aa  157  2e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  31.25 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 		 636 aa  154  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  33.03 
 
 		 652 aa  154  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.1 
 
 		 338 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  33.64 
 
 		 634 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  33.53 
 
 		 656 aa  152  7e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  33.53 
 
 		 654 aa  152  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  35.03 
 
 		 642 aa  152  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  29.91 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  30.63 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  30.63 
 
 		 332 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  30.63 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  30.63 
 
 		 332 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 642 aa  148  1.0000000000000001e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  32.83 
 
 		 670 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  33.64 
 
 		 625 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  35.26 
 
 		 666 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  35.26 
 
 		 666 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  35.26 
 
 		 666 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  35.26 
 
 		 666 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  35.26 
 
 		 666 aa  143  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  35.26 
 
 		 666 aa  143  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  32.09 
 
 		 630 aa  143  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  35.26 
 
 		 666 aa  143  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  34.36 
 
 		 674 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  34.95 
 
 		 666 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  32.64 
 
 		 655 aa  141  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  36.06 
 
 		 651 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 		 651 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  34.97 
 
 		 651 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 		 651 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  36.89 
 
 		 651 aa  135  8e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  34.97 
 
 		 651 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  35.38 
 
 		 650 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  34.77 
 
 		 652 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 		 659 aa  132  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.56 
 
 		 323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  34.86 
 
 		 646 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  29.48 
 
 		 644 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 644 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  34.05 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  31.53 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.67 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  32.69 
 
 		 324 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.83 
 
 		 321 aa  119  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  32.7 
 
 		 326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.09 
 
 		 323 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.9 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.9 
 
 		 319 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.57 
 
 		 308 aa  108  1e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.79 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  29.45 
 
 		 355 aa  102  7e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  24.23 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  23.13 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  24.37 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  30.42 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  30.4 
 
 		 331 aa  93.2  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  25.85 
 
 		 313 aa  92.4  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  29.89 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>