More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1728 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  100 
 
 
645 aa  1273    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  45.71 
 
 
652 aa  588  1e-167  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  46.37 
 
 
634 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  46.21 
 
 
634 aa  580  1e-164  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  44.95 
 
 
636 aa  569  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  45.89 
 
 
647 aa  568  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  47.76 
 
 
642 aa  568  1e-160  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  45.2 
 
 
656 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  45.04 
 
 
654 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  46.13 
 
 
645 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  47 
 
 
642 aa  558  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  45.5 
 
 
643 aa  555  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  45.02 
 
 
645 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  45.24 
 
 
644 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  45.04 
 
 
644 aa  545  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  45.79 
 
 
647 aa  547  1e-154  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  44.98 
 
 
625 aa  547  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  44.87 
 
 
634 aa  545  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  44.55 
 
 
670 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  46.07 
 
 
681 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  46.8 
 
 
666 aa  535  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  45.75 
 
 
680 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  44.64 
 
 
655 aa  523  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  45.44 
 
 
636 aa  519  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  46.9 
 
 
666 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  46.9 
 
 
666 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  46.9 
 
 
666 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  46.9 
 
 
666 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  46.9 
 
 
666 aa  521  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  47.13 
 
 
635 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  46.9 
 
 
666 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  44.81 
 
 
674 aa  519  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  46.9 
 
 
666 aa  521  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  44.48 
 
 
633 aa  514  1e-144  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  45.35 
 
 
650 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  46.06 
 
 
651 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  46.21 
 
 
651 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  45.11 
 
 
652 aa  502  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  44.5 
 
 
640 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  44.85 
 
 
646 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  44.11 
 
 
646 aa  501  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  45.27 
 
 
651 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  45.27 
 
 
651 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  44.95 
 
 
651 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  46.06 
 
 
651 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  44.68 
 
 
659 aa  490  1e-137  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  40.89 
 
 
630 aa  442  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  43.92 
 
 
628 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  43.49 
 
 
628 aa  309  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  33.05 
 
 
332 aa  194  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  33.24 
 
 
332 aa  194  4e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  32.76 
 
 
332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  32.76 
 
 
332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  32.76 
 
 
332 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  42.33 
 
 
312 aa  183  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  35.98 
 
 
317 aa  178  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  34.4 
 
 
335 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  38.67 
 
 
322 aa  175  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  37.77 
 
 
327 aa  175  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  35.33 
 
 
337 aa  174  6.999999999999999e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 
322 aa  173  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  37.27 
 
 
336 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  35.8 
 
 
349 aa  167  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  39.13 
 
 
320 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 
323 aa  160  6e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 
364 aa  158  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  38.07 
 
 
320 aa  157  5.0000000000000005e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.3 
 
 
338 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  33.93 
 
 
338 aa  155  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  36.18 
 
 
321 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  34.55 
 
 
314 aa  154  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  31.47 
 
 
338 aa  153  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  34.13 
 
 
326 aa  152  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  33.73 
 
 
333 aa  152  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  33.43 
 
 
324 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  36.36 
 
 
321 aa  147  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  33.74 
 
 
314 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  30.25 
 
 
315 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  35.61 
 
 
317 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  36.26 
 
 
320 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  36.9 
 
 
323 aa  138  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  36.5 
 
 
325 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 
329 aa  131  3e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.3 
 
 
323 aa  130  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  34.15 
 
 
314 aa  127  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.63 
 
 
323 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  31.38 
 
 
340 aa  125  3e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.42 
 
 
345 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 
316 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  31.47 
 
 
316 aa  122  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.67 
 
 
317 aa  122  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  29.88 
 
 
312 aa  121  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 
316 aa  120  7e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 
322 aa  120  9e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.81 
 
 
326 aa  120  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  27.33 
 
 
319 aa  120  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.1 
 
 
320 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  29.57 
 
 
319 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  31.74 
 
 
319 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  29.88 
 
 
319 aa  118  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>