More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3703 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3703  PfkB  100 
 
 
630 aa  1278    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  40.56 
 
 
647 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  40.58 
 
 
634 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  40.26 
 
 
634 aa  464  1e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  40.22 
 
 
670 aa  464  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  39.34 
 
 
636 aa  458  1e-127  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  39.21 
 
 
645 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  40.16 
 
 
680 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  40.35 
 
 
642 aa  451  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  38.93 
 
 
645 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  39.91 
 
 
643 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  39.75 
 
 
681 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  40.87 
 
 
666 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  38.85 
 
 
652 aa  444  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  39.97 
 
 
642 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  39.87 
 
 
647 aa  439  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  40.89 
 
 
645 aa  442  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  39.06 
 
 
654 aa  439  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  39.21 
 
 
656 aa  442  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  41.2 
 
 
666 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  41.2 
 
 
666 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  41.2 
 
 
666 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  41.2 
 
 
666 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  41.2 
 
 
666 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  41.2 
 
 
666 aa  436  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  41.2 
 
 
666 aa  436  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  41.27 
 
 
651 aa  435  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  39.11 
 
 
625 aa  433  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  40.32 
 
 
635 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  41.11 
 
 
651 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  41.11 
 
 
651 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  40.63 
 
 
652 aa  426  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  40.89 
 
 
650 aa  423  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  40.79 
 
 
651 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  38.58 
 
 
634 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  39.63 
 
 
674 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  39.78 
 
 
646 aa  419  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  38.35 
 
 
644 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  40.79 
 
 
651 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  38.35 
 
 
644 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  41.05 
 
 
651 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  38.44 
 
 
646 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  38.41 
 
 
636 aa  402  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 
655 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  37.66 
 
 
633 aa  398  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  39.27 
 
 
640 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  38.94 
 
 
659 aa  395  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  36.02 
 
 
628 aa  216  9e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  35.45 
 
 
628 aa  212  2e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  35.22 
 
 
327 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  34.91 
 
 
337 aa  167  5e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  35.69 
 
 
322 aa  167  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  32.83 
 
 
332 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  32.63 
 
 
332 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  32.83 
 
 
332 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  32.83 
 
 
332 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  33.02 
 
 
332 aa  161  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.02 
 
 
335 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  34.45 
 
 
323 aa  153  8e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  35.19 
 
 
336 aa  153  1e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  35.06 
 
 
322 aa  152  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
349 aa  150  7e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  32.91 
 
 
314 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  34.71 
 
 
333 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 
364 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  31.58 
 
 
317 aa  144  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  34.91 
 
 
320 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  34.38 
 
 
312 aa  143  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  32.01 
 
 
338 aa  142  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  31.89 
 
 
321 aa  140  7.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  32.18 
 
 
317 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 
320 aa  138  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  33.23 
 
 
324 aa  136  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  28.66 
 
 
338 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 
321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  33.97 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  35 
 
 
323 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  31.65 
 
 
317 aa  128  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  32.91 
 
 
326 aa  125  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  26.11 
 
 
338 aa  124  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  31.78 
 
 
325 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.81 
 
 
315 aa  121  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  32.06 
 
 
319 aa  119  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
329 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.38 
 
 
323 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30 
 
 
320 aa  114  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.3 
 
 
323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  33.56 
 
 
315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  31.65 
 
 
314 aa  111  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.3 
 
 
326 aa  111  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.69 
 
 
327 aa  110  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.75 
 
 
320 aa  108  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  31.01 
 
 
315 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.31 
 
 
319 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  24.38 
 
 
319 aa  104  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  27.47 
 
 
322 aa  104  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.25 
 
 
306 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 
319 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  25.62 
 
 
319 aa  103  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  30.77 
 
 
339 aa  102  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>