More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4189 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  100 
 
 
317 aa  624  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  43.56 
 
 
364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  44.06 
 
 
338 aa  232  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  47.4 
 
 
321 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  46.91 
 
 
320 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  41.35 
 
 
317 aa  226  4e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  44.41 
 
 
327 aa  218  7.999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  42.37 
 
 
349 aa  215  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  42.86 
 
 
336 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  43.45 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  43.45 
 
 
322 aa  212  7.999999999999999e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  44.34 
 
 
314 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  44.19 
 
 
314 aa  209  5e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  45.63 
 
 
321 aa  208  8e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  43.81 
 
 
322 aa  205  7e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  42.54 
 
 
323 aa  205  8e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  44.52 
 
 
320 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  47.32 
 
 
325 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  36.86 
 
 
642 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  44.41 
 
 
323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  35.82 
 
 
635 aa  162  7e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  35.47 
 
 
670 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  34.34 
 
 
634 aa  158  9e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  34.22 
 
 
645 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  34.13 
 
 
640 aa  158  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  35.14 
 
 
645 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  34.13 
 
 
646 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  36.2 
 
 
681 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  36.2 
 
 
680 aa  156  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  33.53 
 
 
337 aa  155  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  35.61 
 
 
645 aa  153  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 
636 aa  153  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  33.83 
 
 
636 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  33.63 
 
 
652 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  34.04 
 
 
647 aa  149  8e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  37.01 
 
 
666 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  33.33 
 
 
647 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  37.01 
 
 
666 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  31.94 
 
 
628 aa  147  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  37.01 
 
 
666 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  36.72 
 
 
666 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  37.01 
 
 
666 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  32.63 
 
 
633 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  37.01 
 
 
666 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  37.01 
 
 
666 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  36.42 
 
 
666 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 
642 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  32.18 
 
 
630 aa  144  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  32.64 
 
 
656 aa  143  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  32.64 
 
 
654 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  32.83 
 
 
634 aa  142  8e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  31.04 
 
 
628 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 
655 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  34.64 
 
 
643 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  32.84 
 
 
634 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  30.27 
 
 
335 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  33.54 
 
 
625 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  34.04 
 
 
659 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 
674 aa  135  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  34.24 
 
 
646 aa  132  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  34.15 
 
 
650 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  27.36 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  30.84 
 
 
324 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
651 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
651 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  34.46 
 
 
651 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  31.23 
 
 
326 aa  126  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  26.91 
 
 
332 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  34.04 
 
 
651 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  34.04 
 
 
651 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  29.61 
 
 
644 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  33.43 
 
 
652 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 
651 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  24.29 
 
 
338 aa  124  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  29.7 
 
 
644 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  29.15 
 
 
333 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  26.91 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  26.58 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  26.91 
 
 
332 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  26.91 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  23.32 
 
 
307 aa  109  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  29.13 
 
 
304 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  34.52 
 
 
320 aa  101  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  33.33 
 
 
318 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  28.8 
 
 
304 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  25.52 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.91 
 
 
326 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.65 
 
 
322 aa  95.5  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.17 
 
 
323 aa  95.9  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  30.84 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.33 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  31.65 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  28.53 
 
 
322 aa  93.6  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 
319 aa  93.2  6e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  31.76 
 
 
318 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.96 
 
 
320 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  26.58 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>