More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3078 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  100 
 
 
314 aa  625  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  78.21 
 
 
320 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  79.1 
 
 
321 aa  448  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  66.03 
 
 
317 aa  413  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  67.2 
 
 
327 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  67.74 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  66.67 
 
 
322 aa  398  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  66.34 
 
 
314 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  67.65 
 
 
349 aa  396  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  66.23 
 
 
336 aa  391  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  67.32 
 
 
321 aa  378  1e-104  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  61.15 
 
 
338 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  60.38 
 
 
364 aa  369  1e-101  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  68.65 
 
 
320 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  67.85 
 
 
325 aa  355  3.9999999999999996e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  60.91 
 
 
312 aa  339  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  62.38 
 
 
322 aa  329  3e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  57.47 
 
 
323 aa  278  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  44.34 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  34.77 
 
 
335 aa  179  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  33.94 
 
 
636 aa  177  3e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  34.95 
 
 
647 aa  176  5e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  35.35 
 
 
656 aa  176  7e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  35.35 
 
 
654 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  33.33 
 
 
634 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  32.21 
 
 
628 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  35.47 
 
 
625 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  32.93 
 
 
643 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  33.03 
 
 
642 aa  170  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  32.21 
 
 
628 aa  169  6e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  37.39 
 
 
337 aa  168  9e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  32.42 
 
 
634 aa  168  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  34.77 
 
 
647 aa  167  2e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  35.47 
 
 
640 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  31.01 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  34.97 
 
 
645 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.62 
 
 
338 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  33.54 
 
 
645 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  33.54 
 
 
645 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  34.36 
 
 
635 aa  159  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 
652 aa  158  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  34.65 
 
 
646 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  33.23 
 
 
680 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  32.93 
 
 
681 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  32.93 
 
 
670 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
636 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 
326 aa  151  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  29.62 
 
 
332 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  29.62 
 
 
332 aa  152  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  31.99 
 
 
634 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  29.62 
 
 
332 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  29.62 
 
 
332 aa  151  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  33.02 
 
 
633 aa  150  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  31.08 
 
 
655 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  33.84 
 
 
659 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  29.3 
 
 
332 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  32 
 
 
642 aa  149  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 
674 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  33.65 
 
 
630 aa  145  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  34.37 
 
 
650 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  34.27 
 
 
319 aa  139  4.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  33.66 
 
 
324 aa  139  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.51 
 
 
322 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  33.54 
 
 
651 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 
651 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 
651 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 
651 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 
651 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  34.45 
 
 
666 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  33.23 
 
 
652 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  34.15 
 
 
666 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  34.15 
 
 
666 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  34.15 
 
 
666 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  34.15 
 
 
666 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  34.15 
 
 
666 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  34.15 
 
 
666 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  34.15 
 
 
666 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.93 
 
 
322 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  33.55 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  29.75 
 
 
644 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.53 
 
 
323 aa  133  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  34.45 
 
 
651 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  29.45 
 
 
644 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  30.74 
 
 
333 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.56 
 
 
320 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  32.1 
 
 
646 aa  123  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  32.19 
 
 
320 aa  122  6e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  33.23 
 
 
317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.81 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.34 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.95 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.95 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.95 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  24.83 
 
 
307 aa  114  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  25.95 
 
 
313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  26.27 
 
 
321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.5 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.5 
 
 
319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.94 
 
 
322 aa  109  6e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>