More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0954 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  100 
 
 
321 aa  662    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  50.64 
 
 
322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  44.37 
 
 
323 aa  253  3e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  44.66 
 
 
355 aa  249  5e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  35.67 
 
 
323 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 
326 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  38.78 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  36.42 
 
 
319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  36.53 
 
 
313 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  36.53 
 
 
313 aa  186  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  36.53 
 
 
313 aa  186  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  35.44 
 
 
313 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  35.44 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  33.76 
 
 
317 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  34.19 
 
 
319 aa  175  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  35.08 
 
 
306 aa  171  1e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  33.55 
 
 
319 aa  170  2e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  32.2 
 
 
323 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  32.25 
 
 
320 aa  169  6e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  32.22 
 
 
336 aa  167  2e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  36.36 
 
 
310 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  34.18 
 
 
314 aa  161  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.6 
 
 
298 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  31.58 
 
 
304 aa  160  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  31.25 
 
 
304 aa  159  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.25 
 
 
311 aa  158  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 
319 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 
319 aa  157  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  32.29 
 
 
320 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  33.23 
 
 
329 aa  155  7e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  30.39 
 
 
307 aa  154  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  32.97 
 
 
337 aa  153  4e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  33.97 
 
 
315 aa  152  8e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  29.74 
 
 
311 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.25 
 
 
309 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  31.8 
 
 
307 aa  150  2e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  32.7 
 
 
322 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  32.29 
 
 
337 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  32.55 
 
 
347 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  32.23 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  34.08 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.88 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.57 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  31.92 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.88 
 
 
316 aa  147  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  33.23 
 
 
343 aa  146  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
319 aa  145  9e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 
315 aa  142  6e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  31.86 
 
 
341 aa  142  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.39 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  31.33 
 
 
323 aa  139  4.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  31.37 
 
 
331 aa  139  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.07 
 
 
319 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  32.57 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  29.41 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  31.87 
 
 
323 aa  139  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.07 
 
 
319 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.07 
 
 
319 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  31.37 
 
 
308 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.22 
 
 
316 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  32.29 
 
 
335 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  30 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  32.05 
 
 
324 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  29.41 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  29.41 
 
 
338 aa  133  3e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  30.53 
 
 
322 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  31.56 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  29.75 
 
 
309 aa  132  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  30.16 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 
319 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  30.04 
 
 
322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  32.1 
 
 
333 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  32.1 
 
 
333 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 
319 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  30.19 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  29.94 
 
 
324 aa  128  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.72 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 
319 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  28.31 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  30.14 
 
 
306 aa  125  9e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  28.4 
 
 
319 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  30.56 
 
 
314 aa  125  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  28.09 
 
 
319 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  25.94 
 
 
327 aa  122  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  28.57 
 
 
345 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  26.91 
 
 
640 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  27.47 
 
 
319 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  28.57 
 
 
320 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  26.28 
 
 
642 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  29.93 
 
 
322 aa  120  3e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.26 
 
 
314 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  31.08 
 
 
338 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  25.71 
 
 
317 aa  119  6e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  31.56 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  31.56 
 
 
338 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  28.14 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.01 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  25.23 
 
 
635 aa  117  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  29.97 
 
 
311 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>