More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1594 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  55.97 
 
 
666 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  55.97 
 
 
666 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  59.06 
 
 
654 aa  795    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  53.74 
 
 
645 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  50.94 
 
 
642 aa  655    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  55.97 
 
 
666 aa  694    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  55.82 
 
 
666 aa  692    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  53.74 
 
 
645 aa  716    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  52.88 
 
 
681 aa  700    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  55.97 
 
 
666 aa  694    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  60.28 
 
 
634 aa  817    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  54.67 
 
 
647 aa  721    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  54.81 
 
 
666 aa  707    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  52.41 
 
 
680 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  59.11 
 
 
625 aa  785    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
652 aa  1350    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  57.66 
 
 
636 aa  778    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  60.28 
 
 
634 aa  811    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  55.94 
 
 
642 aa  725    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  59.22 
 
 
656 aa  797    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  57.73 
 
 
647 aa  790    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  52.49 
 
 
670 aa  704    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  55.97 
 
 
666 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  54.37 
 
 
643 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  55.97 
 
 
666 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  49.15 
 
 
646 aa  634  1e-180  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  48.91 
 
 
659 aa  627  1e-178  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  49.14 
 
 
634 aa  623  1e-177  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  49.22 
 
 
652 aa  617  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  49.38 
 
 
651 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  49.38 
 
 
651 aa  617  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  49.22 
 
 
651 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  49.23 
 
 
650 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  48.91 
 
 
651 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  49.22 
 
 
633 aa  614  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  48.91 
 
 
651 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  46.96 
 
 
674 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  49.69 
 
 
651 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  46.42 
 
 
644 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  48.54 
 
 
646 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  46.42 
 
 
644 aa  593  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  45.71 
 
 
645 aa  588  1e-167  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  45.82 
 
 
655 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  48.67 
 
 
635 aa  585  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  48.59 
 
 
640 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  46.79 
 
 
636 aa  577  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  38.85 
 
 
630 aa  444  1e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  41.48 
 
 
628 aa  327  3e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  49 
 
 
628 aa  328  3e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  34.27 
 
 
337 aa  186  1.0000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.84 
 
 
335 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  35.37 
 
 
327 aa  178  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  35.78 
 
 
322 aa  172  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  30.23 
 
 
332 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  30.23 
 
 
332 aa  170  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  30.23 
 
 
332 aa  170  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  34.98 
 
 
336 aa  171  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  30.23 
 
 
332 aa  170  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  31.07 
 
 
332 aa  170  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
323 aa  160  7e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  32.54 
 
 
338 aa  159  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.58 
 
 
338 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  31.23 
 
 
364 aa  158  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  35.76 
 
 
312 aa  156  9e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  34.33 
 
 
322 aa  156  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  33.64 
 
 
320 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  32.16 
 
 
333 aa  154  4e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  30.09 
 
 
317 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 
349 aa  147  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  32.11 
 
 
321 aa  147  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  32.4 
 
 
314 aa  146  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  33.63 
 
 
317 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  32.52 
 
 
314 aa  145  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  32.51 
 
 
324 aa  144  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  31.67 
 
 
326 aa  144  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  29.34 
 
 
338 aa  143  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  31.9 
 
 
320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.74 
 
 
326 aa  140  7e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  33.43 
 
 
321 aa  136  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  33.03 
 
 
325 aa  131  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  32.73 
 
 
323 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  26.9 
 
 
322 aa  126  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.56 
 
 
323 aa  120  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  31 
 
 
314 aa  118  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.66 
 
 
323 aa  117  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  27.47 
 
 
317 aa  117  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  27.66 
 
 
327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.25 
 
 
322 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  26.98 
 
 
329 aa  111  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  29.27 
 
 
315 aa  110  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  27.44 
 
 
320 aa  108  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  25.15 
 
 
319 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  25.15 
 
 
319 aa  106  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  27.69 
 
 
327 aa  106  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  29.36 
 
 
315 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  26.35 
 
 
319 aa  105  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  27.49 
 
 
330 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  27.49 
 
 
330 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  27.19 
 
 
330 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  24.78 
 
 
324 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>