More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1303 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  88.15 
 
 		 650 aa  1139    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  55.54 
 
 		 645 aa  709    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  58.75 
 
 		 666 aa  689    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  55.08 
 
 		 645 aa  699    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  55.98 
 
 		 670 aa  706    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  58.75 
 
 		 666 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  93.6 
 
 		 652 aa  1191    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  56.49 
 
 		 654 aa  702    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  53.29 
 
 		 643 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  58.9 
 
 		 666 aa  706    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  54.33 
 
 		 642 aa  657    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  56.76 
 
 		 634 aa  709    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  55.23 
 
 		 680 aa  683    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  56.65 
 
 		 656 aa  704    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  93.6 
 
 		 651 aa  1183    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  63.43 
 
 		 659 aa  811    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  53.59 
 
 		 636 aa  685    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 651 aa  1312    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  57.1 
 
 		 625 aa  692    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  99.08 
 
 		 651 aa  1303    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  93.6 
 
 		 651 aa  1183    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  78.02 
 
 		 646 aa  1020    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  55.13 
 
 		 681 aa  689    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  56.6 
 
 		 634 aa  708    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  55.97 
 
 		 647 aa  714    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  56.92 
 
 		 647 aa  708    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  58.75 
 
 		 666 aa  689    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  80.31 
 
 		 674 aa  1067    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  92.98 
 
 		 651 aa  1177    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  58.75 
 
 		 666 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  58.75 
 
 		 666 aa  689    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  58.75 
 
 		 666 aa  689    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  58.75 
 
 		 666 aa  689    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  93.76 
 
 		 651 aa  1174    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  49.23 
 
 		 652 aa  634  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  48.51 
 
 		 634 aa  574  1.0000000000000001e-162  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  47.47 
 
 		 633 aa  547  1e-154  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  47.99 
 
 		 636 aa  533  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  46.21 
 
 		 645 aa  531  1e-149  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  44.57 
 
 		 644 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  44.41 
 
 		 644 aa  521  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  47.29 
 
 		 640 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  45.2 
 
 		 655 aa  519  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  46.76 
 
 		 646 aa  519  1e-146  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  45.83 
 
 		 642 aa  515  1e-144  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  47.32 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  40.79 
 
 		 630 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  48.3 
 
 		 628 aa  315  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  47.73 
 
 		 628 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  33.33 
 
 		 332 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  33.33 
 
 		 332 aa  201  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  33.33 
 
 		 332 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  33.33 
 
 		 332 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  35.33 
 
 		 335 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  32.95 
 
 		 332 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  37.32 
 
 		 337 aa  187  5e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  32.24 
 
 		 338 aa  169  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  37.88 
 
 		 322 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  36.53 
 
 		 327 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  37.8 
 
 		 312 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  36.78 
 
 		 336 aa  154  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  35.49 
 
 		 317 aa  153  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  29.24 
 
 		 338 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  36.47 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 		 364 aa  149  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  38.04 
 
 		 322 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 320 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 338 aa  141  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  31.34 
 
 		 324 aa  139  2e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  33.85 
 
 		 349 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  33.54 
 
 		 314 aa  137  8e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 321 aa  137  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  29.38 
 
 		 333 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  35.98 
 
 		 321 aa  134  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  34.15 
 
 		 317 aa  132  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  35.8 
 
 		 314 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  35.69 
 
 		 320 aa  130  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.76 
 
 		 323 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  34.65 
 
 		 325 aa  124  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 		 326 aa  124  6e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  29.74 
 
 		 326 aa  119  9.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.44 
 
 		 323 aa  115  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.57 
 
 		 317 aa  114  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.49 
 
 		 320 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.49 
 
 		 322 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 322 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.9 
 
 		 337 aa  110  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  35.53 
 
 		 323 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  31.43 
 
 		 306 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2528  protein IolC  30.91 
 
 		 207 aa  106  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000240198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.49 
 
 		 325 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  30.36 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  30.18 
 
 		 319 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  26.59 
 
 		 329 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  29.27 
 
 		 330 aa  102  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  29.57 
 
 		 330 aa  102  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  29.63 
 
 		 330 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 330 aa  101  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  33 
 
 		 315 aa  101  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.41 
 
 		 323 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>