More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1803 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
349 aa  701    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  64.22 
 
 
327 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  67.65 
 
 
314 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  67.42 
 
 
320 aa  381  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  67.08 
 
 
321 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  58.02 
 
 
336 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  61.69 
 
 
323 aa  374  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  65.26 
 
 
321 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  61.29 
 
 
322 aa  374  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  58.9 
 
 
317 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  57.46 
 
 
364 aa  358  8e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  59.22 
 
 
314 aa  353  2.9999999999999997e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  63.58 
 
 
320 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  58.9 
 
 
312 aa  346  4e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  55.38 
 
 
338 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  62.15 
 
 
325 aa  335  5.999999999999999e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  59.42 
 
 
322 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  57.84 
 
 
323 aa  265  8.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  43.34 
 
 
317 aa  216  2.9999999999999998e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  34.58 
 
 
628 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  33.96 
 
 
628 aa  182  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  33.13 
 
 
636 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  35.84 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  35.8 
 
 
645 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  34.02 
 
 
656 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  34.02 
 
 
654 aa  170  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  35.21 
 
 
647 aa  169  9e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  34.91 
 
 
647 aa  168  1e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  34.14 
 
 
634 aa  167  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  35.24 
 
 
643 aa  166  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  33.44 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
642 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  33.53 
 
 
634 aa  164  3e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  33.13 
 
 
645 aa  162  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  32.93 
 
 
645 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  35.93 
 
 
646 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  34.76 
 
 
625 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  36 
 
 
635 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  35.17 
 
 
659 aa  160  3e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.97 
 
 
338 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  35.67 
 
 
640 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  34.28 
 
 
655 aa  159  6e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  30.25 
 
 
338 aa  159  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  35.45 
 
 
636 aa  158  1e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  33.04 
 
 
681 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  34 
 
 
633 aa  156  6e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 
652 aa  155  7e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  33.44 
 
 
630 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  31.4 
 
 
670 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  32.27 
 
 
680 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  33.72 
 
 
674 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  33.91 
 
 
634 aa  153  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  33.61 
 
 
666 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  33.33 
 
 
666 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  33.33 
 
 
666 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  33.33 
 
 
666 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  33.33 
 
 
666 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  33.33 
 
 
666 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  33.33 
 
 
666 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  33.33 
 
 
666 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  33.64 
 
 
642 aa  146  6e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  30.09 
 
 
332 aa  143  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  30.09 
 
 
332 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  30.09 
 
 
332 aa  143  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  30.09 
 
 
332 aa  143  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  34.77 
 
 
650 aa  141  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  34.46 
 
 
651 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  34.77 
 
 
651 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  35.49 
 
 
651 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  30.11 
 
 
644 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  29.11 
 
 
332 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.69 
 
 
326 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  30.61 
 
 
644 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  33.43 
 
 
651 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  32.74 
 
 
652 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  32.08 
 
 
651 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 
651 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.39 
 
 
322 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
646 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 
322 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  28.74 
 
 
355 aa  123  4e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  31.17 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  30.45 
 
 
326 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.27 
 
 
323 aa  119  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  28.48 
 
 
333 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.73 
 
 
322 aa  119  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.3 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.84 
 
 
323 aa  114  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  34.92 
 
 
319 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.69 
 
 
320 aa  107  3e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.08 
 
 
321 aa  104  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.84 
 
 
317 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.13 
 
 
315 aa  101  2e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  29.45 
 
 
319 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.89 
 
 
306 aa  100  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  25.78 
 
 
319 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  29.75 
 
 
331 aa  99  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0869  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 
290 aa  98.6  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  25.78 
 
 
319 aa  99  1e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.85 
 
 
308 aa  98.6  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>