More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4660 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  51.78 
 
 
646 aa  636    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  54.09 
 
 
650 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  53.73 
 
 
659 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  55.61 
 
 
666 aa  659    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  55.59 
 
 
645 aa  717    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  55.77 
 
 
666 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  55.77 
 
 
666 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  54.8 
 
 
645 aa  706    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  54.79 
 
 
681 aa  696    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  55.94 
 
 
652 aa  746    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  55.77 
 
 
666 aa  660    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  54.26 
 
 
652 aa  651    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  68.57 
 
 
656 aa  897    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  54.49 
 
 
651 aa  652    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  55.87 
 
 
666 aa  681    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  53.63 
 
 
651 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  76.61 
 
 
643 aa  1042    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  54.63 
 
 
680 aa  695    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  68.53 
 
 
647 aa  901    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  53.76 
 
 
646 aa  668    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  54.25 
 
 
651 aa  653    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
642 aa  1325    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  53.85 
 
 
670 aa  696    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  70.57 
 
 
634 aa  926    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  55.77 
 
 
666 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  68.25 
 
 
654 aa  893    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  70.66 
 
 
636 aa  955    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  54.49 
 
 
651 aa  654    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  55.59 
 
 
647 aa  718    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  52.52 
 
 
634 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  53.47 
 
 
633 aa  653    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  54.25 
 
 
651 aa  653    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  69.62 
 
 
634 aa  914    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  68.33 
 
 
625 aa  879    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  55.77 
 
 
666 aa  660    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  55.77 
 
 
666 aa  660    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  52.8 
 
 
674 aa  660    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  53.3 
 
 
651 aa  626  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  51.75 
 
 
635 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  49.92 
 
 
636 aa  609  1e-173  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  48.9 
 
 
642 aa  607  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  51.59 
 
 
640 aa  606  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  47.56 
 
 
644 aa  585  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  47.72 
 
 
644 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  47 
 
 
645 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  46.84 
 
 
655 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  39.97 
 
 
630 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  47.75 
 
 
628 aa  333  7.000000000000001e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  47.47 
 
 
628 aa  329  1.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.66 
 
 
335 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  33.91 
 
 
337 aa  184  5.0000000000000004e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  32.57 
 
 
332 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  33.24 
 
 
332 aa  182  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  32.57 
 
 
332 aa  182  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  36.28 
 
 
327 aa  181  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  32.76 
 
 
332 aa  181  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  32.56 
 
 
332 aa  181  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  35.45 
 
 
336 aa  167  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  35.91 
 
 
322 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 
364 aa  161  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  33.03 
 
 
314 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  31.9 
 
 
317 aa  157  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  32.64 
 
 
338 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  30.7 
 
 
338 aa  157  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  35.06 
 
 
312 aa  157  8e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  34.65 
 
 
320 aa  156  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 
323 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  29.82 
 
 
338 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  34.15 
 
 
322 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  32.93 
 
 
349 aa  153  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 
320 aa  148  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 
326 aa  145  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  32.12 
 
 
321 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  32.92 
 
 
324 aa  144  5e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  34.64 
 
 
321 aa  144  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  28.92 
 
 
333 aa  142  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  33.96 
 
 
314 aa  140  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  33.43 
 
 
317 aa  138  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.88 
 
 
322 aa  133  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  30.09 
 
 
326 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  25.44 
 
 
323 aa  130  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  24.7 
 
 
323 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  32.52 
 
 
325 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.26 
 
 
329 aa  125  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  24.47 
 
 
314 aa  123  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  32.93 
 
 
323 aa  121  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.65 
 
 
324 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  25.22 
 
 
333 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  28.44 
 
 
317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  25.72 
 
 
333 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.65 
 
 
322 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  27.98 
 
 
322 aa  115  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  24.54 
 
 
321 aa  115  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 
315 aa  113  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27 
 
 
325 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.13 
 
 
337 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  26.19 
 
 
315 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.17 
 
 
317 aa  111  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  26.41 
 
 
323 aa  110  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  25.89 
 
 
329 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>