More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0662 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  100 
 
 
327 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  64.22 
 
 
349 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  67.2 
 
 
314 aa  393  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  64.4 
 
 
322 aa  387  1e-106  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  68.4 
 
 
321 aa  383  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  67.75 
 
 
320 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  60.62 
 
 
364 aa  378  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  61.34 
 
 
317 aa  374  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  63.11 
 
 
323 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  62.5 
 
 
336 aa  368  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  60.52 
 
 
314 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  60.25 
 
 
338 aa  363  3e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  65.16 
 
 
321 aa  363  3e-99  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  64.5 
 
 
320 aa  355  5e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  63.49 
 
 
325 aa  339  4e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  60.83 
 
 
322 aa  335  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  56.17 
 
 
312 aa  323  3e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  58.82 
 
 
323 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  44.41 
 
 
317 aa  210  3e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  39.09 
 
 
647 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  34.97 
 
 
628 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  35.28 
 
 
628 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  37.61 
 
 
634 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  37.73 
 
 
337 aa  188  1e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  36.7 
 
 
634 aa  187  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  36.09 
 
 
643 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  36.39 
 
 
647 aa  183  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  34.86 
 
 
636 aa  183  3e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  36.28 
 
 
642 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  37.43 
 
 
642 aa  181  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  36.64 
 
 
655 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  39.63 
 
 
635 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 
652 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  36.78 
 
 
654 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  36.78 
 
 
656 aa  178  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  35.19 
 
 
645 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 
646 aa  177  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  35.78 
 
 
670 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  37.04 
 
 
634 aa  176  6e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  37.77 
 
 
645 aa  175  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 
633 aa  175  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  36.09 
 
 
681 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 
636 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  37.65 
 
 
640 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  35.29 
 
 
645 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  36.09 
 
 
680 aa  172  9e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  36.73 
 
 
625 aa  171  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  33.01 
 
 
338 aa  170  3e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  37.77 
 
 
659 aa  170  4e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  35.22 
 
 
630 aa  169  5e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  30.87 
 
 
332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  32.1 
 
 
335 aa  166  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  30.87 
 
 
332 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  30.67 
 
 
332 aa  166  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  30.87 
 
 
332 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 
674 aa  165  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  31.83 
 
 
338 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  30.55 
 
 
332 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  36.89 
 
 
666 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  36.89 
 
 
666 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  36.89 
 
 
666 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  36.89 
 
 
666 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  36.89 
 
 
666 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  36.89 
 
 
666 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  36.89 
 
 
666 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  33.33 
 
 
644 aa  161  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  36.59 
 
 
666 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  33.44 
 
 
644 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  35.91 
 
 
650 aa  156  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  36.53 
 
 
651 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  36.22 
 
 
651 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  34.46 
 
 
326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  33.44 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  35.91 
 
 
651 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  35.91 
 
 
651 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  35.29 
 
 
652 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  35.6 
 
 
651 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 
651 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  35.19 
 
 
646 aa  141  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  32.47 
 
 
333 aa  136  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  33.97 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.71 
 
 
322 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.84 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  37.13 
 
 
319 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 
322 aa  125  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.03 
 
 
323 aa  124  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  25.94 
 
 
321 aa  122  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.86 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.83 
 
 
307 aa  117  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  29.87 
 
 
319 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.69 
 
 
317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.84 
 
 
320 aa  108  9.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.21 
 
 
317 aa  105  9e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  27.65 
 
 
313 aa  103  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  24.18 
 
 
320 aa  103  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  32.79 
 
 
318 aa  102  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  26.88 
 
 
355 aa  102  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.12 
 
 
319 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  23.89 
 
 
313 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.27 
 
 
319 aa  99.4  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>