More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1268 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  100 
 
 		 333 aa  667    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  68.42 
 
 		 324 aa  444  1e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  64.81 
 
 		 326 aa  417  9.999999999999999e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  32.7 
 
 		 338 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  31.78 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  31.78 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  31.78 
 
 		 332 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  31.78 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  32.27 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  32.27 
 
 		 645 aa  162  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  32.75 
 
 		 645 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  30.09 
 
 		 628 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  32.16 
 
 		 652 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  32.43 
 
 		 643 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  32.02 
 
 		 634 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  33.73 
 
 		 645 aa  152  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  29.36 
 
 		 628 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  31.53 
 
 		 647 aa  150  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  31.29 
 
 		 647 aa  150  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 642 aa  149  8e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  28.7 
 
 		 338 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 656 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  34.71 
 
 		 630 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  31.88 
 
 		 635 aa  147  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  29.11 
 
 		 636 aa  146  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  30.95 
 
 		 634 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  30.82 
 
 		 654 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  31.42 
 
 		 634 aa  146  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  31.44 
 
 		 640 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  31.19 
 
 		 625 aa  145  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 633 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  29.94 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  32.02 
 
 		 681 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 		 670 aa  142  7e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  31.93 
 
 		 680 aa  142  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  28.92 
 
 		 642 aa  142  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  31.2 
 
 		 646 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  30.98 
 
 		 644 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 636 aa  139  6e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  30.98 
 
 		 644 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  29.52 
 
 		 655 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  33.93 
 
 		 666 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  32.47 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  28.86 
 
 		 659 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  32.73 
 
 		 666 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  32.73 
 
 		 666 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  32.73 
 
 		 666 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  32.73 
 
 		 666 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  32.73 
 
 		 666 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  32.73 
 
 		 666 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  32.73 
 
 		 666 aa  133  3e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  30.09 
 
 		 338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  28.7 
 
 		 674 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  29.88 
 
 		 650 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  30.23 
 
 		 646 aa  128  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  29.02 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  30.97 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2528  protein IolC  38.02 
 
 		 207 aa  125  9e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000240198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.17 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.05 
 
 		 320 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  30.74 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 651 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  31.6 
 
 		 337 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  30.74 
 
 		 314 aa  122  8e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  29.38 
 
 		 651 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  30.7 
 
 		 329 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  32.62 
 
 		 322 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  34.15 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.34 
 
 		 306 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  35.03 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  30.12 
 
 		 651 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  32.33 
 
 		 344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  29.45 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  31.17 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  30.82 
 
 		 317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  28.49 
 
 		 652 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  25.79 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 349 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  30.52 
 
 		 322 aa  112  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 323 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  27.07 
 
 		 307 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.97 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  29.29 
 
 		 651 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  29.74 
 
 		 651 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  29.74 
 
 		 651 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  30.23 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  28.88 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.57 
 
 		 337 aa  109  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.62 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  27.67 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  30.17 
 
 		 314 aa  106  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  26.44 
 
 		 319 aa  105  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.37 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  26.89 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4059  PfkB domain protein  30.57 
 
 		 325 aa  102  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.867831 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  25.81 
 
 		 307 aa  102  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  26.43 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.16 
 
 		 322 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.33 
 
 		 323 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>