More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1626 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  100 
 
 
319 aa  620  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  42.36 
 
 
329 aa  177  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  40.92 
 
 
320 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  38.54 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  36.42 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  36.42 
 
 
316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  41.47 
 
 
301 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  41.08 
 
 
301 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  41.81 
 
 
323 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  36.27 
 
 
316 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 
316 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  43.07 
 
 
318 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  36.65 
 
 
316 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  39.4 
 
 
342 aa  153  4e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  35.92 
 
 
345 aa  151  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  36.71 
 
 
316 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  38.05 
 
 
339 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  38.87 
 
 
306 aa  150  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  36.89 
 
 
317 aa  150  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  37.46 
 
 
314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  37.66 
 
 
315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  39.07 
 
 
329 aa  147  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  36.69 
 
 
340 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  38.64 
 
 
314 aa  145  6e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  39 
 
 
326 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  39.31 
 
 
344 aa  143  4e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  36.94 
 
 
317 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  38.34 
 
 
324 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  42.7 
 
 
321 aa  138  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  40.98 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  34.44 
 
 
311 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  35.2 
 
 
312 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
319 aa  132  9e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.17 
 
 
313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  34.64 
 
 
327 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  33.65 
 
 
327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  38.61 
 
 
315 aa  130  3e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  42.45 
 
 
314 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  35.22 
 
 
330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  34.88 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 
330 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 
330 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  34.55 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  33.11 
 
 
319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.43 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.22 
 
 
330 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.41 
 
 
320 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 
320 aa  123  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  39.49 
 
 
318 aa  123  5e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 
322 aa  122  9e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  34.55 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  37.22 
 
 
316 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  32.06 
 
 
630 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  36.73 
 
 
320 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  31.74 
 
 
645 aa  118  9.999999999999999e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  36.77 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.27 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.65 
 
 
329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  33.99 
 
 
291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.45 
 
 
329 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  36.45 
 
 
329 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.03 
 
 
270 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.45 
 
 
326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.13 
 
 
329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  34.3 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  34.41 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  36.53 
 
 
316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  34.98 
 
 
363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  36.11 
 
 
316 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  35.85 
 
 
314 aa  112  9e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  37.74 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.52 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.62 
 
 
326 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  33.22 
 
 
322 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.58 
 
 
308 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  28.72 
 
 
320 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  34.47 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.34 
 
 
308 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.34 
 
 
308 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.34 
 
 
308 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  27.67 
 
 
313 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  32.48 
 
 
642 aa  106  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  29.84 
 
 
338 aa  106  7e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0342  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.01 
 
 
334 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  29.9 
 
 
342 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  33.57 
 
 
317 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  30.64 
 
 
655 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  35.84 
 
 
318 aa  104  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  31.97 
 
 
308 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  29.45 
 
 
317 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.34 
 
 
308 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  29.86 
 
 
317 aa  103  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  31.97 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  32.23 
 
 
309 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  34.02 
 
 
323 aa  102  7e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.44 
 
 
316 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  31.94 
 
 
309 aa  102  8e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 
322 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>