More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1382 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  100 
 
 		 326 aa  630  1e-179  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  56.17 
 
 		 339 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  60.48 
 
 		 320 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  52.04 
 
 		 320 aa  243  3e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  48.28 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  49.84 
 
 		 321 aa  216  5e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  49.02 
 
 		 363 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  41.42 
 
 		 329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  42.36 
 
 		 320 aa  182  5.0000000000000004e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  44.24 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  42.28 
 
 		 301 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  41.61 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  41.84 
 
 		 318 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  40.6 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  40.94 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  40.6 
 
 		 316 aa  165  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  39.77 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  38.72 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  44.19 
 
 		 342 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  39.61 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  40.74 
 
 		 344 aa  152  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  36.79 
 
 		 314 aa  148  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  38.19 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.85 
 
 		 329 aa  146  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  36.88 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  37.04 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  37.04 
 
 		 330 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  39 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.22 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  38.41 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  38.22 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  38.22 
 
 		 327 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  38.33 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.9 
 
 		 329 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  35.8 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  35.8 
 
 		 330 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  37.87 
 
 		 316 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  36.73 
 
 		 330 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  37.83 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  37.79 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 328 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  41.01 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  41.57 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  36.98 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  37.37 
 
 		 312 aa  136  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  37.45 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  34.94 
 
 		 330 aa  135  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  34.84 
 
 		 329 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  33.9 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  34.9 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  38 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  36.91 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  36.42 
 
 		 329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  33.7 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.74 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.51 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 324 aa  128  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  38.15 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  41.26 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  35.9 
 
 		 321 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  34.52 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.7 
 
 		 326 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.71 
 
 		 308 aa  115  6.9999999999999995e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  34 
 
 		 318 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  34.96 
 
 		 308 aa  113  5e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  32.57 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  35.71 
 
 		 308 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2071  PfkB domain protein  36.22 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.139149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.71 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  33.58 
 
 		 312 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38.82 
 
 		 291 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.71 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 		 308 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  33.46 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  35.41 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  27.94 
 
 		 313 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  34.96 
 
 		 308 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  31.18 
 
 		 321 aa  106  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  30.4 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.45 
 
 		 320 aa  104  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  25.9 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  34.68 
 
 		 311 aa  103  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.94 
 
 		 322 aa  102  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  32.9 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.42 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4125  PfkB domain protein  28.57 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.197329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  27.02 
 
 		 313 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  37.69 
 
 		 308 aa  99.8  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  34.85 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  31.02 
 
 		 317 aa  99.4  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  32.32 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  31.6 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  35.37 
 
 		 312 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  31.73 
 
 		 325 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  32.32 
 
 		 308 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  31.6 
 
 		 319 aa  99  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>