More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0949 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  85.71 
 
 		 301 aa  474  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  41.14 
 
 		 317 aa  212  7.999999999999999e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  43.67 
 
 		 320 aa  208  9e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  46.15 
 
 		 323 aa  208  9e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  43.43 
 
 		 339 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  42.52 
 
 		 329 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  42.95 
 
 		 326 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  39.4 
 
 		 329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  41 
 
 		 329 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41 
 
 		 329 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  40.67 
 
 		 329 aa  182  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.67 
 
 		 329 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  41.47 
 
 		 319 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  38.8 
 
 		 314 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  41.41 
 
 		 318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  39.67 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 		 330 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  39.18 
 
 		 306 aa  177  1e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  42.31 
 
 		 344 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  30.92 
 
 		 313 aa  177  2e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  40.26 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  38.67 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  39.6 
 
 		 330 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40 
 
 		 329 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  38.54 
 
 		 317 aa  172  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  38.33 
 
 		 327 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  39.93 
 
 		 329 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  43 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  43.33 
 
 		 321 aa  170  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  38.85 
 
 		 312 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  37.33 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  37 
 
 		 327 aa  170  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  38.61 
 
 		 329 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  44.33 
 
 		 321 aa  169  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  36.79 
 
 		 320 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  38.33 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 340 aa  167  2.9999999999999998e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  36.24 
 
 		 314 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  40.51 
 
 		 342 aa  165  9e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  39.04 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  35.22 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  37.21 
 
 		 314 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  37.25 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  38.28 
 
 		 328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  41.91 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  40.98 
 
 		 363 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  37 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  34.67 
 
 		 312 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  37.67 
 
 		 316 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  40.8 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  31.7 
 
 		 313 aa  157  3e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  36.45 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  38.64 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  40.45 
 
 		 308 aa  155  6e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  37.33 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  38.82 
 
 		 324 aa  154  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.7 
 
 		 320 aa  152  5e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  35.88 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  34.1 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  38.75 
 
 		 308 aa  145  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  38.95 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  37.37 
 
 		 311 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  38.95 
 
 		 308 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  32.03 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  32 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 		 320 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  35.85 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  37.83 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 326 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  34.05 
 
 		 321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  31.15 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  34.69 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.91 
 
 		 322 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  38.58 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  38.2 
 
 		 308 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  37.78 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.23 
 
 		 291 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.04 
 
 		 318 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  29.17 
 
 		 299 aa  132  5e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  36.23 
 
 		 316 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  35.21 
 
 		 332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  33.71 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  35.64 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  35.64 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  36.88 
 
 		 319 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  41 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  36.23 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  31.39 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  36.47 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  28.53 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0419  PfkB  30.26 
 
 		 340 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.79 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  34.81 
 
 		 308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  33.6 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.22 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>