More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0274 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0274  PfkB  100 
 
 
306 aa  609  1e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  60.87 
 
 
314 aa  355  5.999999999999999e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  60.47 
 
 
327 aa  354  1e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  60.13 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  60.13 
 
 
330 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  60.94 
 
 
328 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  58.75 
 
 
345 aa  348  5e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  59.14 
 
 
327 aa  348  5e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  59.8 
 
 
330 aa  348  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  58.47 
 
 
329 aa  344  1e-93  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  59.8 
 
 
330 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  59.67 
 
 
316 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  59.33 
 
 
316 aa  342  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  58.47 
 
 
330 aa  340  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  57.19 
 
 
320 aa  341  1e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  59.47 
 
 
330 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  59.47 
 
 
330 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  58.47 
 
 
329 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  58.47 
 
 
329 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  58.47 
 
 
329 aa  329  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  57.81 
 
 
329 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  57.81 
 
 
329 aa  328  9e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  56.76 
 
 
316 aa  324  9e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  57.43 
 
 
316 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  57.09 
 
 
316 aa  322  7e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  53.54 
 
 
340 aa  317  1e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  58.14 
 
 
324 aa  315  5e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  52.51 
 
 
319 aa  312  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  57.48 
 
 
316 aa  311  1e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  53.2 
 
 
314 aa  307  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  50.5 
 
 
319 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  51.52 
 
 
312 aa  298  5e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  52.53 
 
 
315 aa  293  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  50.84 
 
 
317 aa  292  6e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  39.8 
 
 
313 aa  245  6e-64  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.98 
 
 
320 aa  229  4e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  43.34 
 
 
317 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.26 
 
 
270 aa  209  6e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.41 
 
 
320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  38.61 
 
 
329 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  38.39 
 
 
320 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  39.18 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  39.86 
 
 
301 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  34.8 
 
 
314 aa  157  3e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  38.87 
 
 
319 aa  150  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  35.81 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  36.88 
 
 
326 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  36.82 
 
 
323 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  43.11 
 
 
321 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  37.01 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  33 
 
 
322 aa  138  8.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  35.87 
 
 
344 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  35.59 
 
 
339 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  37.5 
 
 
318 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.27 
 
 
320 aa  132  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  33.45 
 
 
323 aa  132  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  35.46 
 
 
318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  33.33 
 
 
315 aa  126  5e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  30.14 
 
 
321 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  34.95 
 
 
341 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  36.3 
 
 
321 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  35.69 
 
 
311 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.48 
 
 
323 aa  122  6e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.85 
 
 
312 aa  122  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  35.13 
 
 
311 aa  121  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  33.44 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.22 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  37.32 
 
 
320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  35.92 
 
 
342 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  33.98 
 
 
363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.81 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  31.36 
 
 
315 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 
308 aa  119  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  34.29 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  32.63 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3217  PfkB domain protein  28.07 
 
 
312 aa  116  5e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  34.64 
 
 
298 aa  116  5e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  31.35 
 
 
312 aa  115  6.9999999999999995e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  26.8 
 
 
313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  29.41 
 
 
332 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.16 
 
 
308 aa  114  3e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  33.6 
 
 
308 aa  112  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.81 
 
 
308 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 
308 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 
308 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.8 
 
 
307 aa  112  8.000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.29 
 
 
320 aa  112  9e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  29.05 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  29.05 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  28.72 
 
 
332 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  29.05 
 
 
332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  34.84 
 
 
308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  31.62 
 
 
299 aa  110  3e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.61 
 
 
306 aa  110  3e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  33.86 
 
 
307 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.47 
 
 
307 aa  109  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.02 
 
 
314 aa  109  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  27.02 
 
 
338 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  31.42 
 
 
311 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  29.12 
 
 
315 aa  108  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>