More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0722 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  100 
 
 
363 aa  701    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  56.67 
 
 
321 aa  281  1e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  49.02 
 
 
326 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  44.48 
 
 
314 aa  215  9e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  40.22 
 
 
343 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  43.89 
 
 
339 aa  199  6e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  48.17 
 
 
320 aa  195  8.000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  42.81 
 
 
320 aa  186  6e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  38.82 
 
 
323 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  39.67 
 
 
329 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  41.06 
 
 
301 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  40.67 
 
 
318 aa  156  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  37.17 
 
 
316 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
301 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  36.77 
 
 
314 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  39.18 
 
 
315 aa  151  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  39.16 
 
 
320 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  38.11 
 
 
316 aa  150  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 
316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  37.87 
 
 
317 aa  143  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  41.18 
 
 
318 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  34.78 
 
 
316 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  34.78 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  33.23 
 
 
317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  34.78 
 
 
345 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  34.08 
 
 
306 aa  134  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 
330 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  35.78 
 
 
340 aa  134  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
322 aa  133  5e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  38.71 
 
 
344 aa  132  6e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  38.87 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  36.18 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  36.18 
 
 
330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  34.41 
 
 
314 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  34.52 
 
 
330 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  33.66 
 
 
327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  35.9 
 
 
316 aa  126  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  30.82 
 
 
319 aa  126  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 
330 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  33.22 
 
 
329 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  35.54 
 
 
329 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.54 
 
 
329 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 
330 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  36.3 
 
 
329 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  27.8 
 
 
326 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  36.33 
 
 
329 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  33.66 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  34.21 
 
 
328 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  35.19 
 
 
329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  33.66 
 
 
315 aa  120  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  34.19 
 
 
329 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  32.57 
 
 
329 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  34.63 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  34.29 
 
 
319 aa  117  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  33.8 
 
 
317 aa  117  3.9999999999999997e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.93 
 
 
313 aa  116  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  37.85 
 
 
342 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.672218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  30.36 
 
 
313 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  37.5 
 
 
327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  34.4 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  37.46 
 
 
321 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  28.53 
 
 
320 aa  109  9.000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  33.23 
 
 
322 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1292  PfkB domain protein  32.98 
 
 
317 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.282801  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  34.29 
 
 
318 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  31.83 
 
 
311 aa  106  6e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  33.8 
 
 
308 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.71 
 
 
308 aa  105  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  34.72 
 
 
318 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.43 
 
 
270 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.56 
 
 
326 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  31.8 
 
 
323 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  30.82 
 
 
325 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3911  PfkB domain protein  33.82 
 
 
321 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0157  KHG/KDPG family aldolase/carbohydrate kinase  27.75 
 
 
590 aa  101  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00034655  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  31.62 
 
 
308 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  31.62 
 
 
308 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2713  PfkB domain protein  26.79 
 
 
340 aa  100  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  29.5 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.86 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0880  ribokinase-like domain-containing protein  27.79 
 
 
339 aa  99.8  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  29.08 
 
 
324 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0857  ribokinase-like domain-containing protein  27.79 
 
 
339 aa  96.7  5e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.16 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.8 
 
 
333 aa  95.9  9e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  32.51 
 
 
308 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  27.52 
 
 
320 aa  95.5  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  32.86 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  26.44 
 
 
332 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  33.22 
 
 
332 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  29.67 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  32.16 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  32.16 
 
 
308 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  32.16 
 
 
308 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  30.8 
 
 
329 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 
325 aa  94  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.9 
 
 
322 aa  93.6  5e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>