More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0115 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  100 
 
 
313 aa  629  1e-179  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  40.52 
 
 
327 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  38.83 
 
 
319 aa  248  1e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.59 
 
 
320 aa  247  2e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  40.39 
 
 
320 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  39.8 
 
 
306 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  39.54 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  40.85 
 
 
312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  38.46 
 
 
329 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  40.79 
 
 
345 aa  238  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  38.69 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.8 
 
 
320 aa  235  7e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.24 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  37.83 
 
 
316 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  38.24 
 
 
329 aa  232  5e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  38.69 
 
 
328 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  38.16 
 
 
316 aa  231  9e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  36.93 
 
 
316 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  38.24 
 
 
329 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  38.24 
 
 
329 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  38.83 
 
 
330 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  38.83 
 
 
330 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  38.98 
 
 
330 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  36.6 
 
 
316 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  40 
 
 
314 aa  230  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  37.5 
 
 
316 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  37.91 
 
 
329 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.44 
 
 
330 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  38.51 
 
 
330 aa  228  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  37.91 
 
 
319 aa  227  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.11 
 
 
330 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  40.39 
 
 
315 aa  226  4e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
324 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  39.34 
 
 
314 aa  222  4.9999999999999996e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  39.61 
 
 
317 aa  220  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 
340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  35.81 
 
 
317 aa  208  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1741  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.47 
 
 
270 aa  193  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  32.25 
 
 
320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 
329 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  30.94 
 
 
339 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  32.23 
 
 
301 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  30.9 
 
 
301 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  31.39 
 
 
323 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 
320 aa  148  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  31.53 
 
 
322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  29.75 
 
 
313 aa  146  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  28.88 
 
 
344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  29.15 
 
 
329 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  30.79 
 
 
314 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  33.57 
 
 
320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.06 
 
 
308 aa  139  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  30.64 
 
 
312 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  29.35 
 
 
315 aa  139  8.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  27.41 
 
 
320 aa  138  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  29.58 
 
 
318 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  28.92 
 
 
315 aa  133  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  29.04 
 
 
321 aa  133  3e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  30.56 
 
 
314 aa  133  3e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  29.17 
 
 
319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  25.81 
 
 
347 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  29.74 
 
 
326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.62 
 
 
315 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  27.27 
 
 
308 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  26.96 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.62 
 
 
325 aa  129  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  27.9 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  29.87 
 
 
314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  27.64 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 
308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  28.4 
 
 
341 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  27.64 
 
 
308 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  29.3 
 
 
316 aa  125  7e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  28.73 
 
 
308 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  28.94 
 
 
318 aa  125  8.000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  27.65 
 
 
308 aa  124  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  29.8 
 
 
318 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  28.98 
 
 
314 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  27.8 
 
 
312 aa  123  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  28.73 
 
 
308 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  28.73 
 
 
308 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  28.29 
 
 
312 aa  122  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  28.8 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  28.11 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  27.88 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  28.69 
 
 
311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  31.48 
 
 
299 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  25.47 
 
 
322 aa  120  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  27.9 
 
 
309 aa  119  7e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  28.89 
 
 
313 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  27.54 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  27.9 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  26.77 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  25.75 
 
 
296 aa  116  5e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  27.6 
 
 
306 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  28.14 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  28.14 
 
 
308 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  26.13 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  26.13 
 
 
313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>