More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000918 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000918  2-dehydro-3-deoxygluconate kinase  100 
 
 
309 aa  644    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4062  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  53.9 
 
 
314 aa  338  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0101  ribokinase-like domain-containing protein  53.9 
 
 
314 aa  338  5e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4070  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  53.9 
 
 
314 aa  338  5e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.254909 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3887  PfkB domain protein  52.96 
 
 
310 aa  333  3e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  51.64 
 
 
310 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4075  PfkB domain protein  52.96 
 
 
310 aa  332  4e-90  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0082  PfkB domain protein  52.61 
 
 
310 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  52.29 
 
 
310 aa  328  8e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3923  2-keto-3-deoxygluconate kinase  50.82 
 
 
309 aa  325  5e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03374  ketodeoxygluconokinase  49.84 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0187  PfkB domain protein  50.16 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3729  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.16 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0191  ribokinase-like domain-containing protein  50.16 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03327  hypothetical protein  49.84 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3831  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.16 
 
 
309 aa  321  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.15496 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4014  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.16 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  50.16 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.327816  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3932  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  49.84 
 
 
309 aa  319  5e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2510  carbohydrate kinase, PfkB  48.04 
 
 
307 aa  297  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2782  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  48.04 
 
 
307 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06349  hypothetical protein  47.4 
 
 
314 aa  285  7e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  47.1 
 
 
312 aa  277  1e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  44.66 
 
 
322 aa  272  4.0000000000000004e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.760619 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3085  2-keto-3-deoxygluconate kinase  45.6 
 
 
311 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.235741  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2125  2-keto-3-deoxygluconate kinase  48.3 
 
 
298 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.190245  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4546  PfkB domain protein  46.43 
 
 
311 aa  266  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00872695  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  43.41 
 
 
312 aa  261  8e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3070  ribokinase-like domain-containing protein  44.48 
 
 
312 aa  256  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0939  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.32 
 
 
318 aa  242  5e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170609  hitchhiker  0.00670311 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1308  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.81 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000271255  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1367  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.47 
 
 
309 aa  229  3e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000226917  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04804  sugar kinase  45.1 
 
 
258 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0399  ribokinase-like domain-containing protein  39.41 
 
 
326 aa  223  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0392221  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1890  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40.53 
 
 
309 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0103461  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3107  ribokinase-like domain-containing protein  40 
 
 
313 aa  221  8e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3006  ribokinase-like domain-containing protein  39.87 
 
 
325 aa  219  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1665  ribokinase-like domain-containing protein  45.18 
 
 
311 aa  219  5e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.304244  normal  0.0158043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1269  2-keto-3-deoxygluconate kinase  40 
 
 
296 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0299866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2368  ribokinase-like domain-containing protein  42.47 
 
 
305 aa  210  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0858  2-dehydro-3-deoxygluconokinase, putative  42.14 
 
 
305 aa  207  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.341435  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0849  putative 2-dehydro-3-deoxygluconokinase  41.81 
 
 
305 aa  205  1e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3673  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.67 
 
 
290 aa  194  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.151137  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3657  PfkB  34 
 
 
307 aa  192  7e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2477  ribokinase-like domain-containing protein  35.88 
 
 
325 aa  187  1e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000321874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3890  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.13 
 
 
304 aa  185  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.413281  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2656  2-keto-3-deoxygluconate kinase  37.79 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000013903  normal  0.883759 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0260  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.12 
 
 
325 aa  184  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2141  ribokinase-like domain-containing protein  38.74 
 
 
302 aa  179  7e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.117677  normal  0.398688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  36.36 
 
 
306 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  36.33 
 
 
318 aa  177  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0836  PfkB  34.1 
 
 
315 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.252584  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5059  ribokinase-like domain-containing protein  36.54 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.542139 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3864  2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.64 
 
 
295 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0735701 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2321  ribokinase-like domain-containing protein  36.51 
 
 
310 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.96044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2414  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 
302 aa  168  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.322028  normal  0.348643 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2574  2-keto-3-deoxygluconate kinase  34.33 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.751635  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4495  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.61 
 
 
304 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.964854  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2840  PfkB domain protein  34.44 
 
 
306 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5084  ribokinase-like domain-containing protein  32.27 
 
 
311 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.599555  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  33.11 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1857  ribokinase-like domain-containing protein  35.12 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.96427  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0490  2-keto-3-deoxygluconate kinase  38 
 
 
250 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.25 
 
 
308 aa  133  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.99 
 
 
308 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  31.5 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  31.5 
 
 
308 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  31.5 
 
 
308 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  30.03 
 
 
316 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01471  putative ketodeoxygluconokinase  47.92 
 
 
153 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  30.94 
 
 
311 aa  125  7e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  30.8 
 
 
308 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  30.51 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  30.15 
 
 
308 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  27.9 
 
 
313 aa  119  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  29.93 
 
 
316 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  30.67 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  29.56 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  30.67 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  28.81 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  30.67 
 
 
308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  28.05 
 
 
308 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  28.05 
 
 
308 aa  117  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  30.67 
 
 
308 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  30.67 
 
 
308 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  30.67 
 
 
308 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  30.67 
 
 
308 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  29.39 
 
 
312 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  31.99 
 
 
308 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  31.99 
 
 
308 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  31.27 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  28.83 
 
 
319 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 
324 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  27.72 
 
 
314 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  27.37 
 
 
309 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  27.47 
 
 
317 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  30.63 
 
 
318 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  26.76 
 
 
301 aa  103  5e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 
301 aa  101  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.37 
 
 
308 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>