More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3107 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
318 aa  650    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  48.05 
 
 
311 aa  296  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  48.7 
 
 
313 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  47.95 
 
 
322 aa  294  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  46.69 
 
 
320 aa  294  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  44.98 
 
 
315 aa  281  8.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  44.92 
 
 
313 aa  281  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  46.75 
 
 
349 aa  277  2e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  44.34 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  44.16 
 
 
313 aa  272  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  43.69 
 
 
325 aa  270  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  45.48 
 
 
314 aa  267  2e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  43.28 
 
 
310 aa  263  3e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  45.31 
 
 
326 aa  257  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  43.28 
 
 
317 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  41.46 
 
 
318 aa  241  9e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  41.8 
 
 
323 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  39.03 
 
 
318 aa  224  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  41.12 
 
 
299 aa  220  1.9999999999999999e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 
318 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  39.03 
 
 
318 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  39.03 
 
 
318 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  38.71 
 
 
319 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  38.06 
 
 
318 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  39.03 
 
 
318 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  38.06 
 
 
319 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  38.06 
 
 
319 aa  210  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  39.03 
 
 
318 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  39.03 
 
 
318 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  39.03 
 
 
318 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  39.03 
 
 
318 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  39.03 
 
 
318 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  39.03 
 
 
318 aa  209  5e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 
320 aa  171  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  36.86 
 
 
271 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.94 
 
 
313 aa  125  9e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  30.57 
 
 
308 aa  123  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.32 
 
 
308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.25 
 
 
323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.19 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.19 
 
 
308 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  29.81 
 
 
308 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.24 
 
 
319 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5091  PfkB  31.58 
 
 
309 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.170499  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  29.43 
 
 
308 aa  117  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  28.88 
 
 
315 aa  116  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  28.26 
 
 
315 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  27.42 
 
 
304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.66 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.42 
 
 
304 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  28.06 
 
 
317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  27.74 
 
 
323 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 
329 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.77 
 
 
323 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  29.3 
 
 
308 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  29.81 
 
 
311 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  26.98 
 
 
337 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  30.34 
 
 
321 aa  105  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  30.83 
 
 
316 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  28.94 
 
 
311 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  27.27 
 
 
298 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  27.83 
 
 
312 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  28.76 
 
 
316 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.87 
 
 
313 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  27.42 
 
 
310 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  32.48 
 
 
316 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  27.27 
 
 
308 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  27.21 
 
 
323 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  27.27 
 
 
308 aa  100  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  24.69 
 
 
344 aa  101  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  32.48 
 
 
316 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  32.12 
 
 
316 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  28.9 
 
 
301 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.56 
 
 
313 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.56 
 
 
313 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.56 
 
 
313 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  27.07 
 
 
306 aa  100  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  29.67 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  29.67 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  29.67 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  29.67 
 
 
308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.54 
 
 
313 aa  99.8  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  28.01 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  27 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  29.67 
 
 
308 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  29.67 
 
 
308 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  29.67 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  25.8 
 
 
308 aa  98.6  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 
310 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  29.26 
 
 
319 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  26.81 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  29.06 
 
 
329 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  27.16 
 
 
326 aa  97.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.21 
 
 
316 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.18 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.18 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  28.57 
 
 
317 aa  96.3  7e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  29.85 
 
 
317 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  24.3 
 
 
323 aa  95.5  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>