More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4766 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  625  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  62.5 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  62.38 
 
 		 315 aa  391  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  59.15 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  54.22 
 
 		 311 aa  318  6e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  50.16 
 
 		 320 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  50.8 
 
 		 322 aa  312  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  49.84 
 
 		 313 aa  308  6.999999999999999e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  51.77 
 
 		 325 aa  302  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  48.7 
 
 		 318 aa  297  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  50.8 
 
 		 325 aa  295  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  43.28 
 
 		 310 aa  268  8e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  44.59 
 
 		 318 aa  266  2e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  41.67 
 
 		 314 aa  256  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  47.56 
 
 		 326 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  46.18 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  46.18 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  46.18 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  45.86 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  45.54 
 
 		 318 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  45.11 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  44.79 
 
 		 319 aa  232  6e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  44.79 
 
 		 318 aa  231  1e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  41.29 
 
 		 323 aa  224  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  40 
 
 		 317 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  42.27 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  42.01 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  42.27 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  42.27 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  42.27 
 
 		 318 aa  205  9e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  41.96 
 
 		 318 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  41.69 
 
 		 318 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  37.38 
 
 		 299 aa  191  1e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 320 aa  180  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  39.26 
 
 		 271 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.17 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.89 
 
 		 313 aa  119  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.8 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  33.6 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  32.02 
 
 		 301 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  33.44 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.88 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  30.6 
 
 		 316 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  30.6 
 
 		 316 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  31.87 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.5 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 		 312 aa  109  8.000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.57 
 
 		 337 aa  109  8.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  29.35 
 
 		 308 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  33.83 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  32.28 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  32.39 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  30.19 
 
 		 308 aa  105  7e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.67 
 
 		 314 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.8 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  31.94 
 
 		 330 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.79 
 
 		 322 aa  102  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  28.53 
 
 		 308 aa  102  9e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  25.62 
 
 		 634 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.84 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  32.1 
 
 		 320 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  28.99 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  29.35 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  33.2 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  33.2 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  31.29 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  30.42 
 
 		 306 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  33.23 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  26.58 
 
 		 308 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  31.53 
 
 		 345 aa  100  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  32.46 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.25 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 		 635 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  28.09 
 
 		 329 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  30.48 
 
 		 327 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  31.23 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  31.23 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.12 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.24 
 
 		 322 aa  99.4  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  31.05 
 
 		 316 aa  99  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.91 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.8 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  27.85 
 
 		 642 aa  99  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  31.63 
 
 		 327 aa  99  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  31.53 
 
 		 330 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  32 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  32.91 
 
 		 329 aa  98.6  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  31.53 
 
 		 330 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  28 
 
 		 319 aa  98.6  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  33.21 
 
 		 330 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  27.82 
 
 		 313 aa  97.8  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  30.29 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  31.56 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  29.28 
 
 		 340 aa  97.8  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 329 aa  97.4  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.38 
 
 		 320 aa  97.1  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  32.59 
 
 		 329 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  28.99 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>