More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3586 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  100 
 
 
326 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  69.23 
 
 
325 aa  444  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  67.38 
 
 
325 aa  436  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  53.09 
 
 
313 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  47.44 
 
 
315 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  46.67 
 
 
322 aa  276  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  48.69 
 
 
311 aa  274  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  49.35 
 
 
349 aa  270  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  47.56 
 
 
313 aa  269  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  44.34 
 
 
320 aa  268  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  45.31 
 
 
318 aa  267  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  45.95 
 
 
313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  40.65 
 
 
314 aa  237  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  39 
 
 
310 aa  229  3e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  47.4 
 
 
323 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  38.1 
 
 
318 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  41.18 
 
 
317 aa  219  6e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  43.99 
 
 
319 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  43.67 
 
 
319 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  38.16 
 
 
299 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  43.67 
 
 
318 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  44.3 
 
 
318 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  43.67 
 
 
319 aa  211  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  44.3 
 
 
318 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  44.3 
 
 
318 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  42.72 
 
 
318 aa  209  8e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  43.04 
 
 
318 aa  189  7e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  43.04 
 
 
318 aa  189  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  43.04 
 
 
318 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  43.04 
 
 
318 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  43.04 
 
 
318 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  43.04 
 
 
318 aa  188  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  42.72 
 
 
318 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  37.14 
 
 
320 aa  182  7e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  40.23 
 
 
271 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  36.05 
 
 
311 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  37.17 
 
 
323 aa  109  6e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.12 
 
 
337 aa  109  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  35.21 
 
 
308 aa  108  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4023  PfkB  35.19 
 
 
311 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102186  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  31.61 
 
 
316 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  31.6 
 
 
316 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 
316 aa  103  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  34.09 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  34.85 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 
308 aa  102  7e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  34.85 
 
 
308 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  35.42 
 
 
308 aa  99.4  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.47 
 
 
308 aa  99.4  8e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  33.96 
 
 
308 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.64 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.82 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.75 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  29.9 
 
 
304 aa  96.7  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1317  carbohydrate kinase  36.36 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.137295  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1077  carbohydrate kinase  36.36 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  31.68 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1806  carbohydrate kinase  36.36 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.26213  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0090  carbohydrate kinase  36.36 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558123  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  29.89 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  34.34 
 
 
312 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  28.3 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  29.23 
 
 
315 aa  95.9  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  29.58 
 
 
304 aa  94.7  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  33.21 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  34.3 
 
 
329 aa  95.1  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.92 
 
 
320 aa  94.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  29.15 
 
 
308 aa  94.7  2e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  36.45 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.32 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  28.05 
 
 
635 aa  94  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  33.33 
 
 
345 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  36.13 
 
 
316 aa  93.2  6e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  32.97 
 
 
298 aa  92.8  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.57 
 
 
323 aa  92.4  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  29.43 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.49 
 
 
317 aa  92.4  9e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  29.89 
 
 
307 aa  92.4  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  35.09 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.44 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  36.45 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2336  ribokinase family sugar kinase  32.35 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.197466  normal  0.0950231 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  34.32 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
330 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  34.32 
 
 
330 aa  90.9  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  35.98 
 
 
308 aa  90.9  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  32.82 
 
 
316 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  30.6 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.74 
 
 
326 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  27.84 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  31.17 
 
 
323 aa  90.5  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  35.98 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  35.98 
 
 
308 aa  90.1  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0086  PfkB domain protein  29.61 
 
 
310 aa  89.7  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  30.53 
 
 
319 aa  89.4  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  30.18 
 
 
335 aa  89  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  30.18 
 
 
319 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1969  PfkB  25.64 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.151768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>