More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4848 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  62.5 
 
 		 313 aa  401  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  56.91 
 
 		 315 aa  365  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  57.61 
 
 		 349 aa  335  5e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  50.8 
 
 		 320 aa  316  4e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  50.8 
 
 		 322 aa  313  2.9999999999999996e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  51.46 
 
 		 311 aa  308  6.999999999999999e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  54.02 
 
 		 325 aa  305  8.000000000000001e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  53.38 
 
 		 325 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  53.09 
 
 		 326 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  46.41 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  44.16 
 
 		 318 aa  272  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  43.77 
 
 		 314 aa  257  2e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  40.65 
 
 		 310 aa  255  8e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  44.09 
 
 		 317 aa  251  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  40.45 
 
 		 318 aa  245  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  46.33 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  46.33 
 
 		 319 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  46.65 
 
 		 319 aa  242  6e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  45.69 
 
 		 318 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  45.69 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  45.69 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  47 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  45.05 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  46.18 
 
 		 323 aa  230  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  44.09 
 
 		 318 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  202  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  43.77 
 
 		 318 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  36.39 
 
 		 299 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  38.1 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  42.48 
 
 		 271 aa  149  5e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  35.48 
 
 		 316 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  34.41 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  34.52 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  30.74 
 
 		 323 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  31.6 
 
 		 642 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  35.66 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  34.19 
 
 		 316 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  33.64 
 
 		 329 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  32.48 
 
 		 345 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  34.5 
 
 		 329 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.31 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.71 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  32.27 
 
 		 308 aa  109  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 		 646 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  32.71 
 
 		 329 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  33.44 
 
 		 314 aa  107  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  28.13 
 
 		 634 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.25 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  30.82 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  30.39 
 
 		 312 aa  106  5e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  34.57 
 
 		 320 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  30.23 
 
 		 304 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  32.36 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.65 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  30.29 
 
 		 319 aa  104  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  30.06 
 
 		 635 aa  104  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  29.17 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  33.86 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  28.99 
 
 		 307 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  27.04 
 
 		 319 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  34.18 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  32.27 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  33.02 
 
 		 330 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  29.9 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  29.89 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  34.84 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  32.27 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  33.33 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  25.08 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  33.33 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  28.05 
 
 		 655 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  26.69 
 
 		 633 aa  100  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.42 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  32.08 
 
 		 301 aa  99.8  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  30.99 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  34.3 
 
 		 314 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  28.8 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  32.1 
 
 		 312 aa  99  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  34.06 
 
 		 330 aa  99  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.85 
 
 		 308 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  26.86 
 
 		 315 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 		 636 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0025  ribokinase-like domain-containing protein  26.06 
 
 		 307 aa  97.1  3e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.112625  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  32.59 
 
 		 306 aa  97.4  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  29.52 
 
 		 640 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  28.26 
 
 		 313 aa  97.1  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>