More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3180 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3180  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 322 aa  659    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.714221  normal  0.0291745 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3416  ribokinase-like domain-containing protein  78.39 
 
 		 311 aa  498  1e-140  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.155618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  56.29 
 
 		 320 aa  373  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0457  ribokinase-like domain-containing protein  56.86 
 
 		 313 aa  354  1e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2482  ribokinase-like domain-containing protein  54.37 
 
 		 349 aa  328  9e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  51.13 
 
 		 315 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3639  kinase, pfkB family  49.21 
 
 		 318 aa  315  5e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000277248  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  50.8 
 
 		 313 aa  313  2.9999999999999996e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  50.8 
 
 		 313 aa  312  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3107  ribokinase-like domain-containing protein  47.95 
 
 		 318 aa  294  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00442891  hitchhiker  0.000119063 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  49.02 
 
 		 325 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  43.96 
 
 		 310 aa  278  7e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  48.86 
 
 		 325 aa  277  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  44.09 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  48.33 
 
 		 317 aa  265  7e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  46.67 
 
 		 326 aa  258  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2513  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.333907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2645  ribokinase-like domain-containing protein  44.73 
 
 		 319 aa  240  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2621  ribokinase-like domain-containing protein  44.41 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.712892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0700  ribokinase-like domain-containing protein  43.77 
 
 		 319 aa  237  2e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.503063 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5928  ribokinase family sugar kinase  43.77 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0639  PfkB  44.87 
 
 		 323 aa  236  6e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202169  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1987  PfkB  44.09 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.903006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2597  ribokinase-like domain-containing protein  44.09 
 
 		 318 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  44.09 
 
 		 318 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0388  PfkB domain protein  39.02 
 
 		 299 aa  225  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0869  PfkB family kinase  44.41 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1032  carbohydrate kinase  44.41 
 
 		 318 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0331  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0561614  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0077  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0873  PfkB family kinase  44.09 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0629  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2463  carbohydrate kinase  44.09 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  38.78 
 
 		 320 aa  202  5e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0693  carbohydrate kinase  42.11 
 
 		 271 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.54 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  30.94 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  34.25 
 
 		 329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  31.82 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  30.1 
 
 		 323 aa  112  6e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.92 
 
 		 333 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  31.44 
 
 		 308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  26.79 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  30.92 
 
 		 333 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  31.21 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  31.82 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  29.65 
 
 		 311 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  29.7 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  29.49 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2260  carbohydrate kinase  31.82 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.11211  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  31.06 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 		 308 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  33.58 
 
 		 301 aa  102  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 		 309 aa  102  9e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 		 312 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  28.15 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3280  2-keto-3-deoxygluconate kinase  27.72 
 
 		 312 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.3989  normal  0.0530742 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  32.94 
 
 		 308 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  28.76 
 
 		 642 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  28.7 
 
 		 329 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2753  PfkB  30.3 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.116104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  28.9 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1694  ribokinase-like domain-containing protein  29.92 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  27.41 
 
 		 313 aa  100  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  30.68 
 
 		 308 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  28.46 
 
 		 320 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.27 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  29.17 
 
 		 308 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  27.47 
 
 		 323 aa  99.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  28.15 
 
 		 306 aa  99  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  28.83 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  30.34 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  30.34 
 
 		 308 aa  98.2  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  28.24 
 
 		 319 aa  97.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4769  2-Keto-3-deoxygluconate kinase  30.3 
 
 		 311 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  25.41 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  25.41 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  27.57 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  31.7 
 
 		 301 aa  96.7  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  26.4 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  27.69 
 
 		 325 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  29.08 
 
 		 323 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  30.27 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  28.25 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  28.24 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  27.81 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2198  PfkB family kinase  33.58 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  25.54 
 
 		 315 aa  94.7  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  25.25 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  25.25 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  25.25 
 
 		 313 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2161  PfkB family kinase  33.58 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.971976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.1 
 
 		 317 aa  94.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2326  carbohydrate kinase  33.58 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.473076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  27.48 
 
 		 304 aa  94  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  27.91 
 
 		 319 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>