More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2905 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  100 
 
 
306 aa  622  1e-177  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  64.03 
 
 
304 aa  395  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  64.03 
 
 
304 aa  396  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  62.67 
 
 
298 aa  375  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  63.19 
 
 
307 aa  376  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  61.89 
 
 
311 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  60.4 
 
 
307 aa  370  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  60.4 
 
 
311 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  61.72 
 
 
309 aa  346  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  54 
 
 
337 aa  327  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  52.81 
 
 
308 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  51.68 
 
 
323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  43.73 
 
 
319 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  43.39 
 
 
319 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  43.73 
 
 
319 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  43.39 
 
 
319 aa  247  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  43.39 
 
 
319 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 
322 aa  215  9e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  40.06 
 
 
316 aa  190  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  39.4 
 
 
317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  34.75 
 
 
323 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  39.87 
 
 
316 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  32.39 
 
 
319 aa  179  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  34.43 
 
 
347 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  39.55 
 
 
316 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  33.55 
 
 
323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  36.1 
 
 
336 aa  171  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  35.08 
 
 
321 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
319 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 
319 aa  171  1e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  35.46 
 
 
313 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  35.46 
 
 
313 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  35.46 
 
 
313 aa  171  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  35.76 
 
 
326 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  35.41 
 
 
307 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  38.59 
 
 
316 aa  166  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  32.79 
 
 
355 aa  166  5.9999999999999996e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  34.47 
 
 
322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  34.82 
 
 
313 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  34.82 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  36.93 
 
 
323 aa  161  1e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  32.69 
 
 
319 aa  161  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  34.08 
 
 
319 aa  159  5e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  32.35 
 
 
322 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  33.75 
 
 
337 aa  155  6e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  31.05 
 
 
315 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  36.25 
 
 
319 aa  149  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.86 
 
 
320 aa  146  3e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.72 
 
 
315 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 
319 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  32.32 
 
 
341 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  30.72 
 
 
315 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  30.35 
 
 
315 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 
319 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  34.29 
 
 
319 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  29.64 
 
 
319 aa  143  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
319 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  33.87 
 
 
319 aa  143  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  31.05 
 
 
314 aa  142  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  34.41 
 
 
343 aa  140  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  33.65 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  36.86 
 
 
328 aa  140  3.9999999999999997e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  32.82 
 
 
323 aa  137  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  31.6 
 
 
320 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  37.31 
 
 
306 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  32.48 
 
 
335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  31.17 
 
 
310 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  34.06 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  33.55 
 
 
338 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  32.2 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  33.23 
 
 
325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  32.91 
 
 
338 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  32.84 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  28.9 
 
 
314 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  31.29 
 
 
332 aa  125  1e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  31.35 
 
 
332 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  31.65 
 
 
326 aa  124  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.17 
 
 
317 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  33.02 
 
 
329 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  32.05 
 
 
323 aa  122  8e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  31.25 
 
 
315 aa  122  8e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  29.87 
 
 
320 aa  122  8e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  31.95 
 
 
308 aa  122  9e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  31.2 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  28.96 
 
 
315 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.22 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 
322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  32.96 
 
 
306 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  32.09 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  28.34 
 
 
333 aa  117  3e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  32.87 
 
 
327 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  33.23 
 
 
346 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  34.8 
 
 
312 aa  116  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  32.27 
 
 
317 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  30.63 
 
 
332 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  32.53 
 
 
322 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  31 
 
 
308 aa  115  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  32.7 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>