More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0928 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  100 
 
 		 321 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  44.48 
 
 		 320 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  43.44 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  42.72 
 
 		 326 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  38.77 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  44.76 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  40.38 
 
 		 311 aa  197  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  41.99 
 
 		 303 aa  196  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  42.29 
 
 		 313 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  41.54 
 
 		 309 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  39.81 
 
 		 303 aa  192  8e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  41.35 
 
 		 317 aa  192  9e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  42.58 
 
 		 316 aa  190  2.9999999999999997e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  39.81 
 
 		 306 aa  189  4e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  39.5 
 
 		 306 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  40.69 
 
 		 322 aa  182  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  35.87 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  39.81 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  39.68 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  38.49 
 
 		 346 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  38.1 
 
 		 306 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  39.27 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  40.34 
 
 		 328 aa  170  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  37.14 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  39.1 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  37.03 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  39.48 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  39.37 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  37.89 
 
 		 317 aa  166  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  38.56 
 
 		 308 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  36.16 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  37.26 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  36.83 
 
 		 306 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  36.16 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  36.19 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  38.49 
 
 		 308 aa  162  6e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.79 
 
 		 315 aa  162  8.000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  36.48 
 
 		 326 aa  162  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  35.56 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  38.54 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  36.31 
 
 		 319 aa  160  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  34.6 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 321 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  37.74 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  34.29 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  36.59 
 
 		 315 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0525  PfkB domain protein  39.31 
 
 		 316 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.844644  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  36.25 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  36.25 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  36.02 
 
 		 312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  37.42 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  34.78 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  34.59 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  36.83 
 
 		 310 aa  150  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  35.42 
 
 		 309 aa  148  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  36.89 
 
 		 309 aa  147  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  35.65 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  35.16 
 
 		 307 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  38.02 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  34.93 
 
 		 323 aa  145  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.64 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  37.54 
 
 		 332 aa  145  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  36.83 
 
 		 335 aa  145  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  37.69 
 
 		 310 aa  142  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  35.35 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  35.38 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  36.71 
 
 		 300 aa  142  8e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  36.05 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  37.06 
 
 		 315 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.48 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  33.09 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  36.74 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  28.3 
 
 		 319 aa  129  5.0000000000000004e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  34.59 
 
 		 317 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.84 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  35.4 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  33.09 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  34.33 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  36.91 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7036  fructokinase  38.75 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.94 
 
 		 311 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  33.33 
 
 		 311 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  33.08 
 
 		 309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  31.11 
 
 		 337 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  29.78 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  32.11 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  30.91 
 
 		 315 aa  114  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  35.66 
 
 		 332 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  31.54 
 
 		 320 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.04 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.04 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.04 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 		 322 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  27.66 
 
 		 315 aa  109  6e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  34.44 
 
 		 344 aa  108  9.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  33.75 
 
 		 316 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  32.97 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>