More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2416 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  624  1e-178  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  69.97 
 
 		 312 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  54.11 
 
 		 322 aa  319  3.9999999999999996e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  45.51 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  46.5 
 
 		 321 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  47.27 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  47.25 
 
 		 306 aa  239  5e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  43.51 
 
 		 312 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  46.47 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  46.45 
 
 		 308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  44.09 
 
 		 312 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  45.63 
 
 		 308 aa  230  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  45.63 
 
 		 308 aa  228  7e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  42.21 
 
 		 312 aa  228  9e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  44.66 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  45.16 
 
 		 308 aa  223  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  41.08 
 
 		 323 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  44.66 
 
 		 306 aa  221  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  42.95 
 
 		 316 aa  221  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  44.44 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  44.84 
 
 		 308 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  42.39 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  43.55 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  41.1 
 
 		 306 aa  200  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  41.48 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  43.23 
 
 		 311 aa  195  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  41.16 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 315 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  40.76 
 
 		 322 aa  189  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  43.09 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  40.51 
 
 		 306 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  37.74 
 
 		 308 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  43.55 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  39.43 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  39.24 
 
 		 314 aa  160  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  36.31 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  38.41 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  36.36 
 
 		 307 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  37.22 
 
 		 326 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  37.34 
 
 		 315 aa  153  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  38.59 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  35.74 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  36.62 
 
 		 334 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  35.35 
 
 		 329 aa  142  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  35.99 
 
 		 320 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  38.56 
 
 		 335 aa  141  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  30.16 
 
 		 319 aa  141  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  35.9 
 
 		 316 aa  138  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  35.02 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  37.35 
 
 		 316 aa  137  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  35.64 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  29.5 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  32.3 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  32.57 
 
 		 323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 		 315 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  34.82 
 
 		 333 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  33.76 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  28.9 
 
 		 315 aa  129  7.000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3872  ribokinase-like domain-containing protein  36.59 
 
 		 300 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  35 
 
 		 320 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  35.6 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  28.48 
 
 		 315 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20450  sugar kinase, ribokinase  35.03 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.229997  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  36.28 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.27 
 
 		 313 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  34.34 
 
 		 344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.81 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.81 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.5 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.81 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  32.98 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  36.62 
 
 		 312 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  31.27 
 
 		 308 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  34.72 
 
 		 338 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  34.49 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  35.18 
 
 		 309 aa  119  9e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0198  PfkB domain protein  37.65 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  32.81 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 317 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  30.19 
 
 		 310 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  26.77 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  32.81 
 
 		 317 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  34.62 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  37.39 
 
 		 284 aa  116  6e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  34.86 
 
 		 306 aa  116  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  27.59 
 
 		 314 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.7 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  33.65 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.46 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.63 
 
 		 319 aa  112  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0298  fructokinase, putative  37.24 
 
 		 302 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  33.54 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30.57 
 
 		 320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  34.59 
 
 		 298 aa  109  5e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3386  fructokinase, putative  36.01 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0217609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0526  fructokinase  36.01 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.29396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2033  putative fructokinase  36.01 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0334  putative fructokinase  36.01 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.894295  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0347  putative fructokinase  36.01 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.494645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>