More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0291 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  100 
 
 		 337 aa  693    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  57.88 
 
 		 336 aa  370  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  52.96 
 
 		 335 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  53.61 
 
 		 343 aa  298  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  45.96 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  42.72 
 
 		 328 aa  232  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  41.18 
 
 		 323 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  43.9 
 
 		 338 aa  219  5e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  42.51 
 
 		 331 aa  219  5e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  43.9 
 
 		 338 aa  218  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  42.5 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  39.26 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  39.26 
 
 		 319 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  38.96 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  38.96 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  37.61 
 
 		 319 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  39.21 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  37.61 
 
 		 319 aa  199  6e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  38.61 
 
 		 322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  37.8 
 
 		 319 aa  197  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  37.38 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  37.74 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  36.84 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  33.84 
 
 		 323 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  37.07 
 
 		 323 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  36.68 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  33.75 
 
 		 306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  36.31 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  33.23 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  30.43 
 
 		 319 aa  167  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  35.29 
 
 		 313 aa  165  8e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  35.16 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  34.98 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  35.16 
 
 		 304 aa  164  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  32.29 
 
 		 321 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  33.87 
 
 		 307 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  33.23 
 
 		 311 aa  160  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.36 
 
 		 307 aa  157  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  36.02 
 
 		 319 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  34.85 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  33.93 
 
 		 319 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  32.81 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  33.65 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  33.65 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  33.65 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  32.48 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  34.17 
 
 		 355 aa  152  7e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  33.33 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  33.04 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  33.63 
 
 		 319 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  31.97 
 
 		 323 aa  149  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  33.33 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 		 319 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  30.89 
 
 		 319 aa  149  9e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  33.33 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  32.4 
 
 		 325 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  30.56 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.41 
 
 		 319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 307 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  29.94 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  32.72 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  32.41 
 
 		 314 aa  142  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  32.91 
 
 		 310 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  29.97 
 
 		 324 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  33.23 
 
 		 341 aa  139  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  30.84 
 
 		 329 aa  138  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  30.21 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  30.21 
 
 		 333 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 315 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  31.06 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  29.88 
 
 		 324 aa  132  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.31 
 
 		 327 aa  130  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  30.37 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  30.75 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  32.47 
 
 		 306 aa  122  7e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  31.13 
 
 		 316 aa  122  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  31.13 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  30.7 
 
 		 320 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.33 
 
 		 316 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  31.13 
 
 		 316 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  30.23 
 
 		 308 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.45 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  28.32 
 
 		 338 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  31.25 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  31.61 
 
 		 309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  28.65 
 
 		 346 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  29.9 
 
 		 308 aa  112  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  28.02 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  27.03 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  27.52 
 
 		 332 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  29.57 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  27.52 
 
 		 332 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  27.78 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  31.63 
 
 		 308 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  26.07 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  30.7 
 
 		 306 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  31.17 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  30.74 
 
 		 318 aa  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  30.89 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>