More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4464 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  96.87 
 
 
319 aa  635    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  97.18 
 
 
319 aa  641    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  100 
 
 
319 aa  657    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  97.18 
 
 
319 aa  637    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  96.24 
 
 
319 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  42.02 
 
 
308 aa  269  5e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  43.46 
 
 
323 aa  269  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  41.97 
 
 
337 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  44.23 
 
 
307 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  43.73 
 
 
306 aa  253  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  44.05 
 
 
309 aa  250  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  43.79 
 
 
311 aa  248  1e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  41.12 
 
 
307 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  40.46 
 
 
311 aa  243  3e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  41.06 
 
 
298 aa  234  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  40.53 
 
 
304 aa  226  6e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  40.2 
 
 
304 aa  223  4.9999999999999996e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  33.97 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  31.33 
 
 
323 aa  166  4e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.06 
 
 
323 aa  161  1e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  34.92 
 
 
319 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  32.68 
 
 
313 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  32.68 
 
 
313 aa  160  4e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  32.68 
 
 
313 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  33.33 
 
 
313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  33.33 
 
 
313 aa  155  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  34.39 
 
 
319 aa  146  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 
322 aa  142  6e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  30.31 
 
 
319 aa  142  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  37.39 
 
 
328 aa  142  8e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  30.97 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  31.66 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  30.97 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  33.33 
 
 
337 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.41 
 
 
321 aa  139  8.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 
319 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  30.99 
 
 
319 aa  138  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  31.35 
 
 
319 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  27.53 
 
 
314 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  31.31 
 
 
336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.45 
 
 
326 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  30.09 
 
 
319 aa  135  9e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  30.67 
 
 
319 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  27.81 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 
317 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  32.52 
 
 
338 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  32.22 
 
 
338 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  34.18 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  30.96 
 
 
322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
335 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.52 
 
 
310 aa  125  9e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  28.49 
 
 
347 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  29.27 
 
 
315 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  27.48 
 
 
307 aa  123  4e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  29.15 
 
 
315 aa  123  4e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  29.52 
 
 
320 aa  123  5e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  33.22 
 
 
322 aa  122  6e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  27.99 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  27.83 
 
 
355 aa  121  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  29.01 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  31.66 
 
 
343 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  32.73 
 
 
331 aa  120  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  32.86 
 
 
329 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2458  ribokinase  31.45 
 
 
302 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3232  ribokinase  31.45 
 
 
302 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.493529  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  29.27 
 
 
645 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  32.69 
 
 
323 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  25.61 
 
 
319 aa  115  1.0000000000000001e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.85 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  33.12 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.76 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.87 
 
 
320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  29.04 
 
 
325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3488  ribokinase  31.76 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232463  normal  0.188896 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  31.13 
 
 
324 aa  112  6e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.78 
 
 
317 aa  113  6e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  31.33 
 
 
316 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  28.66 
 
 
315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  30.42 
 
 
345 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  30.48 
 
 
316 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  27.76 
 
 
308 aa  109  6e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  27.52 
 
 
333 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  27.52 
 
 
333 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  24.54 
 
 
628 aa  107  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2876  ribokinase-like domain-containing protein  26.06 
 
 
312 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.421827  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  24.7 
 
 
628 aa  106  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  28.25 
 
 
324 aa  106  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  28.4 
 
 
338 aa  106  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  28.14 
 
 
316 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  30.79 
 
 
340 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  31.91 
 
 
306 aa  103  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4640  ribokinase  29.62 
 
 
305 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.162899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  26.17 
 
 
320 aa  102  8e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1849  PfkB domain protein  29.92 
 
 
316 aa  102  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541004  normal  0.0446674 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
315 aa  102  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  29.86 
 
 
341 aa  102  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0556  ribokinase family sugar kinase  28.04 
 
 
308 aa  102  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.987541  hitchhiker  0.0000000000000234776 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  29.62 
 
 
317 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4750  ribokinase-like domain-containing protein  29.32 
 
 
310 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>