More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0116 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  100 
 
 
324 aa  647    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  50.63 
 
 
323 aa  322  7e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  49.69 
 
 
325 aa  321  9.000000000000001e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  46.06 
 
 
327 aa  297  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  45.48 
 
 
324 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  44.83 
 
 
333 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  44.51 
 
 
333 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  48.44 
 
 
329 aa  288  9e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  39 
 
 
346 aa  191  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  36.94 
 
 
338 aa  182  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18161  putative carbohydrate kinase  33.53 
 
 
332 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.409365  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  39.21 
 
 
319 aa  175  9e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  34.82 
 
 
338 aa  170  4e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  35.12 
 
 
338 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  32.63 
 
 
332 aa  160  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0100  putative fructokinase  37.54 
 
 
318 aa  159  4e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.14054  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18371  putative carbohydrate kinase  32.34 
 
 
332 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.455738  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  32.93 
 
 
332 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  34.95 
 
 
317 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  29.81 
 
 
322 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  28.48 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  33.23 
 
 
319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  29.75 
 
 
355 aa  132  6e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  32.2 
 
 
323 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  29.94 
 
 
321 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.95 
 
 
315 aa  125  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  33.13 
 
 
328 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 
315 aa  120  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  29.32 
 
 
323 aa  119  7e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  29.88 
 
 
337 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  27.97 
 
 
336 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  33.96 
 
 
316 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  32.66 
 
 
308 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  33.96 
 
 
316 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  30.31 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.66 
 
 
326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  31.13 
 
 
319 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  32.19 
 
 
337 aa  112  9e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  31.5 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  31.13 
 
 
319 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  33.02 
 
 
316 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  31.19 
 
 
319 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  30.22 
 
 
319 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  29.94 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  30.23 
 
 
309 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  28.48 
 
 
307 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  30.79 
 
 
319 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  30.12 
 
 
319 aa  107  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  31.96 
 
 
343 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  26.96 
 
 
319 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  30.46 
 
 
319 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  29.76 
 
 
338 aa  106  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  32.99 
 
 
306 aa  106  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  29.46 
 
 
338 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.18 
 
 
322 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  27.71 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  27.71 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  27.56 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30.79 
 
 
323 aa  104  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  27.71 
 
 
313 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.55 
 
 
320 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3290  PfkB domain protein  26.25 
 
 
320 aa  103  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  27.88 
 
 
313 aa  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  23 
 
 
319 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  25 
 
 
645 aa  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  30.13 
 
 
319 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  30.14 
 
 
307 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  31.21 
 
 
304 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 
319 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 
319 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  31.21 
 
 
304 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  26.6 
 
 
319 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  31.51 
 
 
316 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  29.19 
 
 
319 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  32.26 
 
 
306 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  33.45 
 
 
311 aa  100  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  28.12 
 
 
319 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  29.74 
 
 
315 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  29.75 
 
 
335 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  32.42 
 
 
307 aa  99.4  7e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  28.27 
 
 
343 aa  99  9e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  28.88 
 
 
319 aa  99  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  25.72 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  27.52 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  26.23 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  27.55 
 
 
322 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3763  PfkB domain protein  25.23 
 
 
301 aa  94.4  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00234329  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  31.9 
 
 
298 aa  94  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  25.4 
 
 
314 aa  93.2  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0220  ribokinase  28.96 
 
 
305 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.328501  normal  0.180212 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  23.28 
 
 
628 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  31.86 
 
 
312 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1904  ribokinase-like domain-containing protein  25.96 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0842808  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  28.01 
 
 
319 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  30.92 
 
 
309 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  29.19 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  27.95 
 
 
347 aa  90.1  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  23.68 
 
 
315 aa  89.7  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.01 
 
 
311 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  22.89 
 
 
315 aa  89.4  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>