More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0616 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 
315 aa  638    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  97.46 
 
 
315 aa  626  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  44.3 
 
 
319 aa  263  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  39.94 
 
 
314 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  35.65 
 
 
323 aa  190  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  35.96 
 
 
322 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  36.08 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  37.22 
 
 
315 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  37.22 
 
 
315 aa  178  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  31.85 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  31.85 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  31.85 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  32.06 
 
 
313 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  32.06 
 
 
313 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  35.81 
 
 
310 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  31.66 
 
 
308 aa  167  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  34.29 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.72 
 
 
322 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  31.48 
 
 
317 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  34.38 
 
 
333 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.6 
 
 
326 aa  158  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  34.06 
 
 
333 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  32.7 
 
 
320 aa  157  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  32.6 
 
 
319 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  31.87 
 
 
325 aa  152  5e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  31.31 
 
 
355 aa  150  2e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  31.05 
 
 
306 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  31.6 
 
 
307 aa  149  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  31.92 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  34.05 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  30.55 
 
 
347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  33.44 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  31.37 
 
 
324 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  30.87 
 
 
307 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  29.65 
 
 
337 aa  145  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  30.16 
 
 
319 aa  144  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  32.14 
 
 
320 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  32.62 
 
 
328 aa  144  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  30.39 
 
 
311 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  33.95 
 
 
322 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  29.41 
 
 
329 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.5 
 
 
320 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  30.72 
 
 
298 aa  141  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  29.55 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  32.93 
 
 
331 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  33.44 
 
 
306 aa  140  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  33.11 
 
 
341 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  31.43 
 
 
309 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  33.21 
 
 
323 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.18 
 
 
307 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  28.66 
 
 
323 aa  136  4e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 
322 aa  136  5e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  29.5 
 
 
322 aa  136  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  32.02 
 
 
338 aa  136  5e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  30.22 
 
 
327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  31.45 
 
 
315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1088  PfkB domain protein  30.16 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332998  normal  0.446333 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  32.49 
 
 
316 aa  135  9e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  32.43 
 
 
338 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  28.92 
 
 
313 aa  133  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  31.8 
 
 
323 aa  132  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  31.27 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  30 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  32.24 
 
 
306 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  33.33 
 
 
312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  30.62 
 
 
312 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  31.17 
 
 
320 aa  129  6e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  29.68 
 
 
304 aa  129  6e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  27.56 
 
 
316 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  28.53 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  32.24 
 
 
312 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  27.95 
 
 
324 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  27.24 
 
 
316 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 
312 aa  122  7e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  31.05 
 
 
309 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  35.1 
 
 
313 aa  122  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  27.99 
 
 
336 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  32.52 
 
 
317 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  30.97 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  30.65 
 
 
309 aa  120  3e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  31.06 
 
 
337 aa  120  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1304  carbohydrate kinase, PfkB  30.19 
 
 
316 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  32.45 
 
 
321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  28.85 
 
 
306 aa  119  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  29.93 
 
 
308 aa  119  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  30.16 
 
 
308 aa  118  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  29.78 
 
 
306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2652  PfkB domain protein  30.82 
 
 
316 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  27.44 
 
 
319 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  30.5 
 
 
316 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  29.94 
 
 
306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  30.38 
 
 
335 aa  116  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  34.09 
 
 
310 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  27.67 
 
 
311 aa  115  6.9999999999999995e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  31.49 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  26.35 
 
 
345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  29.72 
 
 
343 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  29.78 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>