More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2648 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_2648  carbohydrate kinase  100 
 
 
336 aa  692    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00340862  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0291  carbohydrate kinase  57.88 
 
 
337 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3387  ribokinase-like domain-containing protein  52.04 
 
 
335 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.248011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0561  carbohydrate kinase  50.78 
 
 
343 aa  296  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.335543 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4346  ribokinase-like domain-containing protein  47.02 
 
 
323 aa  245  9.999999999999999e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.126881 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  41.51 
 
 
323 aa  231  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  41.3 
 
 
328 aa  218  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1272  fructokinase  41.1 
 
 
338 aa  218  1e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1240  ribokinase-like domain-containing protein  41.1 
 
 
338 aa  216  5e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.36269  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0067  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 
319 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000323678 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3987  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
319 aa  209  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0334499  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 
319 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0069  ribokinase-like domain-containing protein  37.77 
 
 
319 aa  206  3e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.518061  normal  0.0251177 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  38.39 
 
 
319 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0064  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 
319 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0068  PfkB domain protein  37.77 
 
 
319 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4285  ribokinase-like domain-containing protein  37.46 
 
 
319 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1777  PfkB domain protein  39.56 
 
 
331 aa  202  7e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  37.58 
 
 
322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  35.76 
 
 
319 aa  189  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  36.42 
 
 
317 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00666  Sugar kinase, ribokinase family protein  35.78 
 
 
322 aa  181  1e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  35.85 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 
319 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  35.33 
 
 
319 aa  176  5e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  36.1 
 
 
306 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0600  aminoimidazole riboside kinase  34.38 
 
 
323 aa  169  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  33.64 
 
 
337 aa  169  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  31.89 
 
 
322 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  31.9 
 
 
326 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  33.44 
 
 
323 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  32.22 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  32.49 
 
 
311 aa  165  8e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0351  aminoimidazole riboside kinase  32.69 
 
 
307 aa  161  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.735787  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0971  aminoimidazole riboside kinase  32.92 
 
 
308 aa  161  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00309121  normal  0.0346902 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0909  fructokinase  34.65 
 
 
314 aa  159  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0720396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  33.33 
 
 
307 aa  159  5e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  31.09 
 
 
311 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  33.13 
 
 
315 aa  156  4e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0716  fructokinase  34.78 
 
 
313 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0666  fructokinase  34.78 
 
 
313 aa  155  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0752  fructokinase  34.78 
 
 
313 aa  155  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4203  aminoimidazole riboside kinase  33.54 
 
 
309 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.831759  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0075  PfkB domain protein  33.03 
 
 
355 aa  155  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.0000000523624  normal  0.570334 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  31.68 
 
 
315 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2019  aminoimidazole riboside kinase  33.01 
 
 
298 aa  150  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0270358  normal  0.162694 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  35.16 
 
 
307 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0734  fructokinase  34.45 
 
 
310 aa  149  7e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.399737  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4122  PfkB  32.5 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0915  fructokinase  33.12 
 
 
313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  33.76 
 
 
304 aa  144  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  33.55 
 
 
304 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0808  fructokinase  32.81 
 
 
313 aa  143  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4283  aminoimidazole riboside kinase  31.91 
 
 
319 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2234  PfkB domain protein  32.28 
 
 
319 aa  142  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4312  aminoimidazole riboside kinase  32.52 
 
 
319 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4397  aminoimidazole riboside kinase  31.61 
 
 
319 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4395  aminoimidazole riboside kinase  31.31 
 
 
319 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2029  PfkB domain-containing protein  32.52 
 
 
323 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.159361  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4464  aminoimidazole riboside kinase  31.31 
 
 
319 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.680577  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2919  PfkB  31.46 
 
 
325 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000103669  normal  0.041423 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1030  PfkB domain protein  31.37 
 
 
329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.185699  normal  0.340834 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  29.8 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0266  PfkB domain protein  30.31 
 
 
324 aa  132  7.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  26.67 
 
 
319 aa  131  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4085  PfkB domain protein  29.38 
 
 
322 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.212948  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  32.72 
 
 
319 aa  125  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 
315 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2734  PfkB  28.62 
 
 
327 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228263  normal  0.103091 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  27.99 
 
 
315 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1025  PfkB domain protein  28.48 
 
 
333 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00743339 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0996  PfkB domain protein  28.48 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1630  PfkB domain protein  30.62 
 
 
341 aa  118  9.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  27.97 
 
 
324 aa  117  3e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  28.22 
 
 
308 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  29.6 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  30.28 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  31.19 
 
 
315 aa  112  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0144  putative fructokinase  29.66 
 
 
319 aa  113  6e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01230  fructokinase  26.95 
 
 
311 aa  110  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.826599  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01731  putative carbohydrate kinase  27.99 
 
 
346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17531  putative carbohydrate kinase  28.36 
 
 
338 aa  110  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2461  ribokinase-like domain-containing protein  29.07 
 
 
316 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281644  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  29.48 
 
 
326 aa  107  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  30.57 
 
 
322 aa  107  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  25.48 
 
 
320 aa  107  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18191  putative carbohydrate kinase  27.65 
 
 
332 aa  105  9e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  30.13 
 
 
306 aa  105  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22680  PfkB domain protein  25.31 
 
 
314 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.531518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  27.01 
 
 
308 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1720  putative carbohydrate kinase  27.35 
 
 
332 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.259189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  28.48 
 
 
307 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 
302 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1204  putative carbohydrate kinase  29.55 
 
 
338 aa  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2556  PfkB domain protein  28.75 
 
 
316 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0308577  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  27.78 
 
 
302 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.18 
 
 
317 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  27.92 
 
 
306 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20791  putative carbohydrate kinase  28.4 
 
 
338 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  28.17 
 
 
322 aa  99.4  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.888122 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>