More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1115 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1115  PfkB domain protein  100 
 
 		 322 aa  642    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  63.34 
 
 		 314 aa  360  1e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1102  PfkB domain protein  45.67 
 
 		 306 aa  233  3e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.534067  normal  0.794033 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0759  PfkB domain-containing protein  44.33 
 
 		 306 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0795  PfkB domain protein  35.71 
 
 		 315 aa  206  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2257  putative fructokinase  42.95 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2239  ribokinase-like domain-containing protein  42.62 
 
 		 306 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  42.05 
 
 		 308 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0115  fructokinase  39.2 
 
 		 308 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0931  ribokinase-like domain-containing protein  42.3 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.63818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0139  PfkB domain protein  38.87 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.49186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0112  fructokinase  39.2 
 
 		 308 aa  192  7e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0686594  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0135  PfkB domain protein  38.87 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.472286 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2866  ribokinase-like domain-containing protein  40.44 
 
 		 322 aa  189  4e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.888122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  38.61 
 
 		 312 aa  189  7e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2416  ribokinase-like domain-containing protein  40.76 
 
 		 319 aa  189  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306608  normal  0.469914 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  41.83 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2220  ribokinase-like domain-containing protein  41.21 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.101084 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2946  ribokinase-like domain-containing protein  41.81 
 
 		 306 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.014237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0129  ribokinase-like domain-containing protein  38.54 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0836  PfkB  38.76 
 
 		 306 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.408369  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2797  carbohydrate kinase  43.46 
 
 		 308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.375815  normal  0.409466 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0928  fructokinase  40.69 
 
 		 321 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0530  fructokinase  36.88 
 
 		 308 aa  180  2.9999999999999997e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.955105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  38.61 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2434  carbohydrate kinase, PfkB  38.61 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4474  ribokinase-like domain-containing protein  37.5 
 
 		 315 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.491556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33610  sugar kinase, ribokinase  38.54 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.469298 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1891  ribokinase-like domain-containing protein  41.18 
 
 		 313 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3429  ribokinase-like domain-containing protein  42.17 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343851  normal  0.0113168 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0527  PfkB domain protein  38.44 
 
 		 312 aa  170  3e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34340  fructokinase  39.07 
 
 		 310 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00034201  normal  0.472957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0108  ribokinase-like domain-containing protein  40.2 
 
 		 310 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2919  fructokinase  38.74 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.141756  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  38.16 
 
 		 323 aa  169  8e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3490  ribokinase-like domain-containing protein  38.02 
 
 		 320 aa  168  1e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.32556  normal  0.0478454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0921  putative fructokinase  42.76 
 
 		 315 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2120  ribokinase-like domain-containing protein  39.81 
 
 		 311 aa  165  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.56437  normal  0.133617 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16610  PfkB-family carbohydrate kinase  33.99 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1269  PfkB domain protein  39.23 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2035  ribokinase-like domain-containing protein  36.69 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3928  Fructokinase  38.74 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.693657  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5753  PfkB domain protein  35.31 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.231801  normal  0.0725817 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7023  ribokinase-like domain-containing protein  35.95 
 
 		 319 aa  156  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0744  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 311 aa  156  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3260  ribokinase-like domain-containing protein  36.59 
 
 		 320 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.846286 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4360  PfkB  40.45 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493573  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4446  ribokinase-like domain-containing protein  40.45 
 
 		 317 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0570373 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4740  ribokinase-like domain-containing protein  40.13 
 
 		 317 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26450  sugar kinase, ribokinase  34.98 
 
 		 317 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.184834  normal  0.35054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  36.48 
 
 		 309 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  33.33 
 
 		 323 aa  148  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1715  PfkB domain protein  35.08 
 
 		 334 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.189965 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0616  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00109848  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0635  ribokinase-like domain-containing protein  33.95 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.377528  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4916  ribokinase-like domain-containing protein  36.93 
 
 		 309 aa  142  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637785  normal  0.273858 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1154  ribokinase-like domain-containing protein  31.13 
 
 		 319 aa  139  4.999999999999999e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4605  PfkB domain protein  32.8 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1118  PfkB domain protein  36.39 
 
 		 316 aa  139  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.59245  normal  0.875512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0966  PfkB domain protein  35.1 
 
 		 346 aa  139  8.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.610521  decreased coverage  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0062  ribokinase-like domain-containing protein  36.91 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2896  PfkB domain protein  35.09 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  32.2 
 
 		 322 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0223  PfkB domain protein  34.19 
 
 		 317 aa  135  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  31.68 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  36.63 
 
 		 312 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 		 319 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1494  fructokinase, putative  30.52 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.215965  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2601  ribokinase-like domain-containing protein  36.76 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000338156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4616  PfkB domain protein  34.95 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4798  ribokinase-like domain-containing protein  37.86 
 
 		 317 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.28126  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  35.62 
 
 		 303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 326 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1827  ribokinase-like domain-containing protein  36.18 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23000  sugar kinase, ribokinase  33.66 
 
 		 303 aa  128  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0053  ribokinase-like domain-containing protein  35.29 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6323  ribokinase family sugar kinase  37.7 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2994  ribokinase-like domain-containing protein  38.83 
 
 		 302 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0996  PfkB domain protein  35.47 
 
 		 298 aa  127  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.809854  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2884  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 		 302 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00940  sugar kinase, ribokinase  32.8 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  38.33 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2360  PfkB  38.19 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2974  ribokinase-like domain-containing protein  38.19 
 
 		 302 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1904  PfkB  35.74 
 
 		 336 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0331042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3021  ribokinase-like domain-containing protein  37.54 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1648  fructokinase  39.18 
 
 		 308 aa  124  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0424  ribokinase-like domain-containing protein  33.86 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.808327  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0931  PfkB  35.74 
 
 		 323 aa  123  4e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0595887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0109  ribokinase-like domain-containing protein  34.39 
 
 		 335 aa  123  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3202  PfkB  34.85 
 
 		 344 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  39.62 
 
 		 284 aa  122  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1782  fructokinase  29.52 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0521883  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1510  fructokinase  29.52 
 
 		 315 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00409278  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2969  ribokinase-like domain-containing protein  37.01 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  32.92 
 
 		 322 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0069  ribokinase-like domain-containing protein  32.29 
 
 		 319 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.615124  hitchhiker  0.0000000296005 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0501  PfkB domain protein  35.87 
 
 		 320 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.501412  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0065  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00032055 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>